问题 circos作图时用到的links.txt要如何得到？

已经使用MCScanX做了共线性分析得到了collinearity和tandem文件，但我用命令的水平太菜调不出links.txt格式，请问有没有可以用的脚本或者工具之类的？

文章 seqkit序列处理神器的常用命令

...列查找多个文件的公共序列concat          连接多个文件中具有相同ID的序列convert         转换FASTQ质量编码格式：支持格式包括：桑格，Solexa和Illuminaduplicate       重复序列N次faidx           创建FASTA索引文件并提取子序列...

问题 关于转录组结果分析视频中FPKM值的意义

老师您好在无参转录组视频基因表达分析的学习中，碰到了FPKM和TPM值，有等于0的，也有大于1，甚至大于10的， 请问这代表什么意思？ 我的理解是：大于0表示基因表达，值越大表达水平越高，请问老师，这样理解可以吗？

问题 学习有参转录组分析中遇见的问题

老师，您好，我在做转录组有参分析的过程中，跟着老师的步骤操作，但是第一个问题就难住了我，我在使用hisat2_extract_splice_sites.py的时候，系统提醒这个命令找不到，如图片所示，这是怎么回事呢？我用的是Linux系统虚拟机操...

问题 treemix中按照课程操作cat w.sh，提示没有这个文件

treemix，按照课程中，一步一步操作，cat w.sh，提示没有这个文件。 该怎么处理

问题 转录组结果中如何挑选自己关心的基因？

问题 linux中无法显示share文件夹

问题 NCBI上传数据中的libraryID是什么？

问题 怎么辨别鉴定的家族成员中是否有假基因？

问题 如何挂载（挂载过程中共享文件夹错误）

问题 老师，您好，我按照课程安装doekcr，下载了群体遗传学的镜像，在启动镜像的时候总是显示错误，请问老师该如何解决呢？

...在启动镜像的时候执行指令：docker run --rm -it -m 4G --cpus 1 -v /home/share/pop-evol:work omicsclass/pop-evol-gwas:latest 总是显示Error response from daemon：failed to create task for container: failed to create shim task: OCI runtime create failed: runc create failed: unable to ...

文章 bugbase指定表型预测

...内存，所以需要给docker更多的内存) docker run --rm -m 25 -v D:\project\bugbase:/work -it omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 2.生成指定表型的预测文件（运行默认为16S数据） make.user.table.r -i costom_pathway/ 参数说明 -i    准备好指定表型的文件...

问题 微生物多样性分析的程序复制shell中不能运行

蓝色背景的是我shell中的程序，黑色的是视频中的程序，在运行到原始测序数据两端合并时，出现以下错误，请指教问题所在

文章 geo_gene_exp_download.r GEO数据自动下载与整理

...化的。如果数字在几百几千，则是未经转化的。使用过程中常见问题：1. 如果中通下载中断 可以用wget -c 下载完成之后再运行该命令：wget -c 继续下载2.GPL文件下载失败： 可以自己下载GPL文件, GPL 文件应去掉含有#号的行，第一...

话题 如何从GEO中选择适合自己分析的数据