文章 perl中判断数组中是否含有某个元素

...grep函数有两个参数。一个代码块和一个列表。 对于列表中的每个元素，它的值会被赋到$_（Perl的标量默认值）, 然后执行代码块。如果代码块的返回值是false，相应值被丢弃。如果代码块返回值是true, 相应值会作为返回值之一...

问题 群体遗传分析过程中无法构建进化树

过程中supergene.phy和fasttree.nwk都可以生成，但利用ggtree.r -t fasttree.nwk -f $GROUP -g Group -n fasttree构建进化树就开始报错，邱老师解答：

问题 在共线性分析中发现结果太少

在共线性分析中发现结果太少，将minspan=30改为=0后结果仍然很少，能不能调整cscore的值呢，这个值指向的是哪个参数啊，是类似于E值的存在吗，怎么调整比较好呢

文章 seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选

seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除

问题 MEME motif 统计每条序列中motif的种类

...图片形式直观展示motif分布以外，还想统计一下每条序列中motif的分布情况。请问该如何批量操作？ 在得到的结果文件中，有看到下图所示的motif信息。[ ]之间的括号以外的数字表示motif编号，但是不知道该如何批量提取。 非常...

问题 关于小麦基因家族中的同源性问题

你好，我想问一下，对于小麦的基因家族来说，如何判断基因在小麦ABD三个家族中的同源性呢 能跟我讲一下具体的操作方法和流程吗，谢谢，感激不尽

问题 我想问一下，什么叫做新的基因，比如说我做的无参转录组，找到的差异基因能在NR数据库中注释到别的物种中，这个算是新的基因吗？

问题 在鉴定长链非编码RNA分析中，合并转录本之后，如何批量从gffcmp.combine.gtf文件中提取class_code为i, u,和x的转录本?谢谢

文章 MNP标记设计中DP的计算方法

MNP标记设计中多态性窗口的筛选标准为DP指标： DP= t / c ( N ,2)，其中c ( N ,2) 是N 个品种中任意两种的品种组合对数， t是每对品种在窗口内至少有两个分散的 SNP 的数量。 如下所示： 假如有3个品种，1个窗口内有3个SNP。其中品...

用户 生长中的乙弘菌( 'ч' )

文章 考研倒计时19天：双非大学的研究生还有用吗？

...做研究”的门儿， 本科阶段大家的毕业论文，其实是差不了太多的， 真正名校本科表现优异的基本都有了保研的资格，他们也不会与我们进行直接的竞争， 所以说，大家基本上都处于同一起点， 这个时候，能不能跑完全程...

问题 蛋白结构域完整性的验证

...，有个问题想请教您。 比如说我鉴定到一条NBS-LRR基因，用NCBI中的CDD工具发现它的NBS结构域是完整的，但是用Pfam数据库验证又不是完整的，让人很迷惑。 到底该怎样去判断一个基因中包含的某个蛋白结构域是否完整呢？

文章 遗传家系图代表意思以及绘制技巧

一、家系图详细讲解 通过对家庭成员中某种疾病的发病情况进行调查分析可以判断该病是否为遗传病。通过家系调查可以绘出家系图（或称系谱）来显示某种疾病在家族中的传递特点，借此判断该病是否为遗传性疾病及其遗...

问题 找不到课程中需要的镜像

文章 转录组结果解读及分析技巧

...测转录组不是闹着玩，能发文章肯定还是要发的，但现实中往往很多老师是这样的↓： ↓被分配了做转录组实验的学生是这样的： 小编就遇到不少老师拿着几年前的转录组数据，迟迟无法下笔写作，毕竟工作繁忙，很难系...