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问题 泛基因家族分析,系统发育树构建

...问题是:1.私有基因很多,一千多,需要都用来构树吗?2.构树后,该怎么给每个簇命名,我是根据拟南芥基因聚类结果,即查看该簇内拟南芥基因的注释看编码什么蛋白属于什么亚家族,则认为该簇谷子基因为这个亚类,但是...

问题 hmmer网站搜索蛋白序列中的结构域,得到几个domain,但是序列范围重叠。

...hits found是3即得到3个Thioredoxin domain: thioredoxin、thioredoxin_2、thioredoxin_9,但是序列范围重叠,72-174、85-172、64-173,是什么情况?实际这个蛋白序列中只有一个thioredoxin domain吗? 用NCBI-CDD搜索的结果类似,也是给出multi-dom,但是序列...

文章 linux 远程服务器文件上传下载使用软件Filezilla

...project.org/ 注意下载客户端软件,可安装在windows上: 2.安装很简单,双击文件一直下一步就安装好了,之后就可以打开了,如下所示: 注意,IP地址前面加sftp:// ,端口可以不填,默认是21。   用户名密码获得参考putty链接远...

文章 进化树美化操作详解- iTOL

...击Tree upload即可上传已经构建成功的.nwk格式树文件。 2. 点击上传的树文件进入操作界面,我们主要通过右上角的控制面板进行基本操作。 (1)在Basic面板中,有Mode options、Label options、Branch options三大板块,Basic面板主要负责...

文章 组学大讲堂教程优惠信息

...力奖,我们也是唯一入选的生物信息类团队! 即日起至20221月3日,网易云课堂将开展9周年庆活动,我们组学大讲堂也将配合该活动发布三重优惠: 优惠购买方式: 1. 扫码进入组学大讲堂课程页面 2. 找需要学习的课程,...

问题 带编制!招聘博后、讲师、副教授。福建农林大学转录系统生物学课题组招聘

...以下背景优先: 1.基于高通量测序的表观遗传学技术 2. Linux、r或python编程、功能基因组分析 3. 蛋白质/核酸化学、分子机器设计、超分子化学   相关待遇: 1、按照福建农林大学研人员聘任标准,科研助理4-9万,青年...

问题 老师你好,我想问几个关于无参转录组的问题

...DNAMAN翻译成氨基酸序列并进行后续的预测吗?这准确吗?2、我用DNAMAN翻译的序列和用NCBI上查到的ORF区序列不太一样,我后续预测理化性质什么的话,我用哪一段比较好呢?

问题 转录组分组间差异基因分析

...缘。筛选差异基因的阈值相同,都选定为FDR<0.05 且 |log2FC|>1,即两倍的差异倍数。 1 得到的差异基因数量相差非常多,一个物种的差异基因只有一两百,而另一个物种的差异基因多达9000多。除去可能存在的取样时候的问题...

问题 docker镜像和bio-linux镜像运行meme是出来的结果motif是否有差别?谢谢老师

问题1,docker镜像和bio-linux镜像运行meme是出来的结果motif是否有差别? 问题2,运行meme时由于文件比较大,将一个文件分成两个文件运行了和一个文件运行出来的结果相同吗? 谢谢老师

问题 TBtools 的others界面下没有BioSequence Structure Drawers——Amazing Optional Gene Viewer

...显示,根据您之前发的方法(http://www.omicsclass.com/article/382),采用TBtools, 但是我的TBtools的others界面下没有BioSequence Structure Drawers——Amazing Optional Gene Viewer 这2个选项,如图: 请问这是什么原因呢?我的TBtools软件是在基因家族分...

文章 linux 命令当中出现特殊字符无法传递参数怎么办

...rm会认为是两个目录: 方法1:把他引起来如下; 方法2:转义一下  \ : 其他命令也是一样: 上面只是举例个简单例子,所有linux命令都可以这样解决特殊字符,我觉得引号的方法更省事一些: 下面是我们大讲堂QQ群上一个...

文章 解读:2019年度高被引科学家名单透漏出哪些信息?

就在1119日,科睿唯安公布了2019年度“高被引科学家”名单,在这份名单中,涵盖了全球近60个国家的6216人次的高被引科学家。我们先一起来看看全球排名前10的名单:图:来源于科睿唯安现在问题来了,到底什么是“高被引...

问题 cafe5 Families with largest size 删掉这些基因家族后跑的非常慢

...现这个报错,我按照脚本删掉了差异大的家族,然后跑了2天了还没结果. 另外,删掉这些基因家族后是重新运行base和-k2~-k5还是只运行-k3就行了?

文章 xargs一些常用的小技巧

... 准备一个文本文件复制url cat url.txt | xargs -n 1 -t wget 2,删除过多相同特征的文件,rm命令有参数限制,超过了就会报错,这个时候可以用xargs find ./ -type f -name "*.log" -print0 | xargs -0 rm -f 3,删除空文件 find ./ -name "*" -type f -size...

文章 紧扣前沿热点--多种研究培训,总有你需要的!

...社区解决售后技术问题。 报名链接:https://www.wjx.cn/vm/YkH2HZ2.aspx