老师您好，我想把我的gff文件中的文件名修改成下图格式，怎么操作？"物种简称_染色体号_000001" gene为G，其他为T
动植物基因组组装课程，01.Repeat.sh中有几个问题： 1、 第175行：#deepTE 分类根据https://www.jianshu.com/p/85e54962e2bc一文介绍，先用DeepTE_domain.py对保守domain进行鉴定，再用DeepTE.py借助上一步的保守domain信息分类TE。课程中没有对保守结...
...Devices包函数，可用于生成渐变调色板 函数返回值仍是一个函数，之后输入对应的色板数可获得对应的颜色值，譬如，取红色和绿色之间（rgb)，渐变的五个颜色（如果涉及的颜色不只是红绿，也可以）： > rgb.palette=colorRampPal...
部分软件使用vcf时，需要vcf文件是排序过的。可以使用Tassel软件的run_pipeline.pl来排序。 命令如下： run_pipeline.pl -Xmx20g -Xms1G -SortGenotypeFilePlugin -inputFile snp.vcf -outputFile snp.sort.vcf -fileType VCF 以上命令即可对vcf文件就行排序。
...及分子标记开发流程，对截至目前已完成基因组测序的110个植物进行了鉴定，已发掘微卫星DNA位点 超过2600万个，并为每个位点开发了3对引物。用户可获取目标物种有用的微卫星DNA位点和引物信息，以及每个位点所属物种、位置...
manager@bl8vbox[dupl-id1] /home/manager6/KaKs_Calculator2.0/KaKs_Calculator2.0/bin/Linux/KaKs_Calculator -i 2.axt -o kaks2.txt<br>Method(s): MA<br>Genetic code: 1-Standard Code<br>Please wait while reading sequences and calculating...<br>manager@bl8vbox[dupl-id1] 这是无...
...count + 1 + if (count > 0) { + rowname[j] = paste0(uniname[i], ".", count) + } + } + } + } > rownames(d) <- rowname 参考： https://www.cnblogs.com/liujiaxin2018/p/16325320.html https://www.jianshu.com/p/10733715536f
...ot@108189d98d67 07:48:18 /work/my_reseq/ref]# sh index.sh pearref.fa peargff.gff REF: pearref.fa GFF: peargff.gff GTF: build Index start: RNN CMD:samtools faidx pearref.fa RNN CMD: picard CreateSequenceDictionary R=pearref.fa O=pearref.dict INFO 2024-04-21 07:49:38 CreateSeq...
...系统中搭建python的运行环境，方便大家学习，这里介绍一个快速大家的方法给大家。主要应用的软件为：anaconda； Anaconda简介 Anaconda（官方网站）就是可以便捷获取包且对包能够进行管理，同时对环境可以统一管理的发行版本...
...但事实是，只有极少的人才会真的逆袭，大部分的人没有更好的选项。 学历就是一道门槛，但是并不仅仅985/211才是研究生，双非院校毕业的，也是研究生。 研究生的重点是什么?不是前面的“985/211”，“双非”这些定语， 而...
1. nas 服务端配置 安装nfs工具 yum -y install nfs-utils rpcbind 2.万兆网口设置 vi /etc/NetworkManager/system-connections/enp6s0.nmconnection #内容改为：[connection]id=enp6s0uuid=67c8225e-d935-3c18-b57c-510f9e2f4883type=ethernetautoconnect-priority=-999interface-name=enp6s0[...
...最独特的特性就在于 它的代码对于上下文是敏感的。 每个perl的表达式要么在 scalar 上下文中求值，要么在列表上下文求值 my $scalar = "mendeleev"; #赋值 标量上下文 my @array = ("Alpha", "Beta", "Gamma", "Pie"); #列表上下文 my ($perl, $pytho...
Rscript $scriptdir/compare_errorbar.r -i $table \ > -m $metadata -t groupb \ > -a low -b high \ > --daa_method $m \ > --p_values_threshold 1 \ > --top 20 \ > -o compare_errorbar --prefix low_vs_high_L6 --> Q&A for bioinforma...
...我反复对比视频内容发现视频里的镜像omicsclass/reseq是8.76G,目前镜像更新后的版本是13.8G,会不会是镜像更新后出现了Bug，希望能够得到解答，错误提示在文字最后面。 SEQUENCE_TARGET=201,10 SPRIMER_TASK=pick_detection_primers PRIMER_PICK_LEFT_P...
...时候，为了进行并行化计算，需要设置并行化参数。 /opt/gridengine/bin/lx-amd64/sge_execd 启动计算节点SGE 1.常用命令: systemctl start rpcbind nfs-serversystemctl enable rpcbind nfs-serversystemctl disable iptables.servicenetstat -lntup|grep sge 2.主节点，...