... --i-classifier $silva_classifier \ --i-reads ../02.feature_table/repset-seqs.qza \ #--p-reads-per-batch 100 \ --p-n-jobs 30 \ --o-classification taxonomy.qza
老师在课程中使用的示例文件中vcf文件中四个样本的顺序是双亲，然后子代。但是我发现我的vcf文件的顺序是双亲在后面，两个子代池在前面，这种怎么调整顺序呢，或者会不会影响qtlseq的运行
...的，比较建立在一定的假设上面，所有Cox 模型提出了几个假设： 1. 比例风险假定 各危险因素的作用不随时间的变化而变化，即 不随时间的变化而变化。因此，公式(1)又称为比例风险率模型(PH Model)。这一假定是建立Cox回...
...令时 Rscript $scriptdir/var_density.R -i snp.unknown_multianno.vcf -b 1000000 -c "darkgreen,yellow,red" -t "SNP Density" Rscript $scriptdir/var_density.R -i indel.unknown_multianno.vcf -b 1000000 -c "darkgreen,yellow,red" -t "INDEL Density" 无法生成图例，而且只生成了pdf文件...
...它体内的器官，包括心脏、肝脏、脾脏、肺和皮肤等，多个组织部分均由猴细胞组成， 虽然猴细胞的比例很低，大约在千分之一和万分之一之间， 但是这确实是一只不折不扣的猪猴嵌合体。 据悉，一共有4000个带有猴基因的...
...以及网络中的核心基因。适用于复杂的数据模式，推荐15个样品以上的数据。现在测序价格越来越便宜，得到15个样品数据的成本很低，如果再结合样品性状数据进行模块基因与表型的关联分析，一定能给你的文章增色不少！如...
shift ARRAY shift 这个函数把数组的第一个值移出并且返回它，然后把数组长度减一并且把所有的东西都顺移。如果在数组中不再存在元素，它返回 undef。 如果省略了 ARRAY，那么该函数在子过程和格式的词法范围里移动 @_；它在...
很多项目的数据是多个分组，还有组建重复，因此如果没有批量下载的手段还是挺麻烦，总不能一个个点吧 一般而言有两种常见方法 1 SRA Run Selector直接获取，这个页面链接如下，https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/操作也简单，...
...排序。但是当想排序的列是由字符和数字组成的时候，这个选项就不能达到想要的效果。 1. 例如，对某个文件列进行排序： #cat 1.txt1121232343556781011 #sort 1.txt1101112123233455678 直接使用sort命令，会按照(第一列第一个字符)的顺序...
...分模块划分，且给出了连通性，如何进一步转换成cytoscape绘图的输入文件？ 其他的文件也有，像是基因-模块对应关系列表、模块-模块相关性结果excel展示（包含所有模块两两之间特征值的相关性系数与p值）、基因-模块相关性...
...是有一定功能的结构域。 所以，MEME的输入必须至少有一个Pearson/FASTA格式的序列文件。 命令：meme <dataset> [optional arguments] 这里的<dataset>就是那个序列文件，必须是Pearson/FASTA格式，文件格式示例： >ICYA_MANSE INSECTICYAN...
...力，你一定要对整个流程中的各个流程有所了解，才能够更好的把控。市场调研、用户调研、竞品分析、需求分析、产品设计、交互设计、开发管理、运营策略、数据分析等等，都是一个合格的产品经理，必不可少的业务技能。...
老师，R语言中有一个KNN补值函数叫impute.knn，该函数的源代码中有一个内部函数叫knnimp函数，与该函数中KNN的补值计算流程紧密相关，但是我却找不到这个内部函数的源代码，请问老师，这个内部函数knnimp函数的源代码是否可以...
...图所示： 每条命令作用如下： blastp：使用blastp来将一个蛋白质查询序列与一个蛋白质数据库进行比较。 blastn：使用blastn来将一个DNA查询序列的两条链与一个DNA数据库进行比较。 blastx：使用blastx来将一个DNA序列用所有可能...