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文章 转录组个性化分析之可变剪切分析工具：rMATS turbo

...检测可变剪切事件的常用软件之一，其可以从RNA测序数据中，检测出多种类型的可变剪切事件，并提供了定量和组间差异分析的功能，可对生物学重复的样本进行组间分析。rMATS可识别的可变剪切事件有5种： Skipped exon (SE)：外...

文章 玉米遭受亚洲玉米螟为害时所诱导产生的直接和间接的防御反应及其生理生化和分子机制

...有差异基因进行表达模式聚类，分析玉米螟为害后玉米叶中动态的转录模式。 如上图9个动态转录聚类模式中profile66中有最多的转录本，基因涉及黄酮类、类苯基丙烷、单萜、苯并恶唑嗪酮等合成及植物防卫反应；且这些基...

问题 vcf文件中染色体名字更换

老师您好，我所得到的VCF变异文件中染色体名字有点复杂（如图），我想统一更换为chr格式，请问有什么好的解决办法吗？

问题 亚细胞定位预测所用的序列是基因的蛋白序列还是这类家族的结构域部分的蛋白序列？如MAP基因家族中某个基因的蛋白序列，还是这个基因中MAP结构域的蛋白序列

...列还是这类家族的结构域部分的蛋白序列？如MAP基因家族中，对家族成员进行亚细胞定位预测的时候，用的是某个基因对应的整个蛋白的序列，还是仅仅这个基因中MAP结构域的蛋白序列？如老师们介绍的wolf psort网站是不是可以...

文章 perl 中 grep 的使用

...ep {$brray[$_] eq ""CDS"}  @brray; 在标量上下文里,grep返回匹配中的元素个数;在列表上下文里,grep返回匹配中的元素的一个列表。 更多perl语言知识可观看 Perl语言高级编程 学习！

文章 NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta，gff3，gtf，gb文件等

...基因组gtf文件，获取线粒体所有基因名 以上漾濞槭例子中没有RefSeq信息，接下来以斑胸草雀为例，在斑胸草雀的参考基因组染色体详细表单中定位到Type列为MT的染色体(线粒体基因组)，记下对应的RefSeq（Scaffold序列号）NC_007897.1 ...

文章 免疫共沉淀CoIP实验过程步骤详解，so easy !!

...Triton X-100)，不能用高浓度的去垢剂(0.2%SDS)，细胞裂解液中要加各种酶抑制剂，通常Leupeptin和Aprotinin这两种即可，若蛋白较大，可加胰蛋白酶抑制剂(PMSF)，若涉及到磷酸化信号转导，要加磷酸化抑制剂(如Na3VO4)。同时全程冰上操作...