问题 Mac中bio-linux中无法新建文件，一些命令无法操作怎么办？

Mac 中安装了virtual box，引入了bio-linux，但是一些命令无法操作怎么办？例如无法新建文件。无法新建txt，用了touch txt,mkdir txt都不行。求大神指导怎么在Mac虚拟机上操作bio-linux？万分感谢！

文章 SCI期刊版面费一般是多少？为什么这么贵？要自己出钱吗？

...你是在查不到的话，可以随时来问学霸姐姐~ 学霸姐姐捧不了钱场，捧个人场还是可以的哦！ 生物女学霸，一个自称学霸其实很渣的生物汪，努力将有趣的、有用的、有血有肉的科研那些事儿呈现给大家，关注一个好不啦~

问题 老师您好，我想请问一下下面这个热图用R语言绘制（我买的是您这里的“R语言基础绘图这门课”，用的是pheatmap)，请问一下color这个参数如何设置才能和这个图的一样呢，因为一般都是设置col=c("blue","white","red"), 其它的像下图这种颜色是如何得到的呢

问题 老师，我在重新描述一下问题，mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对，数目不一样，是不同算法的不同结果是吗？做CIRCOS时， 可以用BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对来做吗？我BLAST方法筛出来的串联重复等数目更多一些。

问题 蛋白三级结构分析时，用PSI-blast和SWISS-MODEL自带的模板同时做了，发现SWISS-MODEL自带的模板做出来的相似度更高、GMQE和QMEAN值也更好，同时，两个方法也有重复的模板，想问问老师应该选择相似度更高的，还是选择两种方法都有的模板？

问题 请问一下你们在动植物比较基因组中准备数据中使用的代码脚本运用到哪个软件，具体操作是什么？？

文章 endnote 插入文献 变成临时 大括号{} 不自动更新文献

用endnote在word中插入文献时突然 会出现{Garcia-Mas,2012 #1387} 无效格式大括号，或者变成临时文献插入，如下图 其实很简单，只需要选好style，再更新一下Update Citations and Bibliography，就可以了如下 更多生物信息课程： 1. 文...

问题 在基因家族分析中的顺势作用元件分析中有几个差不多的元件是不是一个元件

请问这三个元件是不是都是ABRE元件啊，还是三种不一样的元件

问题 老师，我在重新描述一下问题，mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对，数目不一样，是不同算法的不同结果是吗？做CIRCOS圈图时， 可以用BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对来做吗？我BLAST方法筛出来的串联重复等数目更多一些。

文章 linux中sed 替换

sed命令可以直接替换文件中的内容其用法如下： sed -i 's/A/a/g' file.txt 参数-i 会在源文件中直接替换，所以要确定后在使用此参数。 s表示替换，后通常跟正则表达式。 该命令会按行替换文件中所有的A，如果只想对文件中的某...

问题 动植物基因组注释问题中重复序列注释的问题

上次提到了提供的docker的images中没有找到repeatmasker的数据库RepeatMaskerLib.h5的问题。紧接着我发现流程中的famdb.py脚本也找不到，这个脚本我再课程提供的脚本文件夹中中没找到，同时我在docker的镜像中也没找到。是不是和RepeatMask...

问题 群体遗传课程admixture的问题

用课程测试的数据运行admixture的时候，显示segmentation fault. 因为docker镜像omicsclass/reseq里面没有找到admixture，所以用conda install另外安装了admixture。我用docker其他镜像的admixture，也是不行，还是显示segmentation fault。

问题 请问老师，gff 文件中有id 信息，但是cds 文件中只有转录本信息，如何进行修改课程脚本，进行cds 提取啊！

问题 老师好，在基因家族分析课程视频里，鉴定基因家族成员时，里面实操用的是基因组的蛋白质序列（pep文件），然而我自己的实验数据是无参转录组，我想问下，我应该用什么文件来鉴定基因家族成员呢？我看到之前有类似问题的答案是unigene或者蛋白质序列，两者有什么区别呢？

基因家族成员鉴定

问题 Rstudio读不出文件中的数据

按照图片中的代码输入文件数据，能够读出dim（FPKM）和names（FPKM）。但是datExpr0命令之后是显示一串空白之后，显示omitted 30 rows（即全部数据都没读出来）。我是把excel表格中的所有数据复制，直接粘贴到新建的txt文件中的，...