...alue<0.05,见下图）。 文章进一步开展ROC曲线分析，结果显示筛选到的10个基因AUC值大于0.5（见下图）。 此外，为探究关键模块中的差异基因是否涉及癌症相关功能，利用DAVID对yellow模块中的所有基因进行了富集分析，结果如下...
...分之间以空格分开即可（不拘多少个空格，但是为了数据显示美观，最好保持一致），每一个chrom下的基因都是属于该对应的染色体上的基因； 2、基因之间有先后顺序，严格按照在染色体上的先后顺序排列； 3、各行之间可以...
...符逻辑运算符赋值运算符其他运算符 算数运算符 下表显示了R语言支持的算术运算符。操作符对向量的每个元素起作用。 +两个向量相加v <- c( 2,5.5,6)t <- c(8, 3, 4)print(v+t)#它产生以下结果 10.0 8.5 10.0-两个向量相减v...
1.算术运算符 下表显示了R语言支持的算术运算符。运算符对向量的每个元素进行操作。 加法(+)， 相加两个向量。示例代码：v <- c( 2,5.5,6); t <- c(8, 3, 4); print(v+t); 执行上面示例代码，得到以下结果 -[1] 10.0 8.5 10.0 减法(-)， ...
...性更明显（见下图B）。 其中Brown模块内GS与MM分析结果显示，该模块内的基因与pathologic_stage显著相关（见下图），并基于MM高于0.8,GS高于0.2 筛选出了39个基因进行后期分析。 3.重要模块基因功能富集 针对Brown模块内的基因...
... Woman 0.0154 0.015 0.015 * T-test 绘图显示 install.packages("ggpubr")library(ggpubr)p <- ggboxplot(mydata, x="group", y = "weight", color = "group", palette = "jco", add = "jitter", short.panel.labs = FALSE)# 添加p值p + stat_compare...
...dir/vcf_start.pl -vcf snp.unknown_multianno.vcf -type snp时总是出错，显示Use of uninitialzed value in division (/) at /work/scripts/vcf_stat.pl line 313.还有Illegal division by zero at /work/scripts/vcf_stat.pl line 312.运算没有结果，请问老师是什么原因呢？
...-common-line][文件或目录1][文件或目录2]#参数 -q或--brief 仅显示有无差异，不显示详细的信息。-y或--side-by-side 以并列的方式显示文件的异同之处。-W<宽度>或--width<宽度> 在使用-y参数时，指定栏宽diff method1.gbff.gff meth...
...变化范围对应的数值大小不同，导致图片中色彩变化难以显示基因在不同样本中的变化趋势，可以对基因在每个样本中基因表达数据进行标准化，使其数值在一定范围内，从而实现热图的优化，而控制参数为scale，对基因（行，r...
...高通量数据Study号或Bioproject号（SRP165999），点击搜索。 搜索结果如下，点击Study号： 这里会显示所有数据下载地址，注意这里是fastq数据。 点击数据下载即可。 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了...
...际绘图时，可能图片大小不合理等等造成图片中部分信息显示不全，譬如下图部分基因label没有完全显示出来，可以在此处进行修改： 对image参数修改，如果在调用etc/image.conf的同时，则需要对相应的参数添加 * 进行标识，具...
...域时发现有些基因结构域不全，好多基因都没有锌指结构显示，我怀疑是 #截取得到序列上的保守结构域序列，注意多个结构域分开提取 #结构域位置 grep -v '#' WRKY_hmmerOut_final.txt|awk 'BEGIN{OFS="\t"}$10==1 {print $1,$18,$19 }' >domain1_fina...
ls命令目录基本操作 ls命令用来显示目标列表，在Linux中是使用率较高的命令。ls命令的输出信息可以进行彩色加亮显示，以分区不同类型的文件。 语法ls（选项）（参数）选项-a：显示所有档案及目录（ls内定将档案名或目录名...
...个mRNA对应于一个geneID的结果，而是一堆转录本在同一行显示出来了，请问为什么会这样 #去除重复的hmmer搜索的转录本ID，多个转录本ID保留一个作为基因的代表，此步建议对脚本输出的文件手动筛选，挑选ID： perl script/select_r...
老师您好，我的测序结果质控的时候发现， FastQC Report 显示结果在Per base sequence content 这一栏大多数呈现下图的样式，我需要cut掉前面几BP吗？如果需要，我应该怎么做呢？