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问题 Admixture算STRUCTURE,出来的CV erro值随着K增大而递增是怎么回事,算了好几组数据都这样

...果的CV值都随着K增大而递增,用的是群体遗传进化课程中docker的代码,如下: workdir=/work #设置工作路径 refdir=$workdir/ref datadir=$workdir/data scriptdir=$workdir/scripts export PATH=$scriptdir:$PATH GROUP=$datadir/yuan.txt #LD过滤 plink --vcf  $wo...

问题 ANNOVAR变异注释报错:Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

...组学大讲堂的云服务器,没有权限,不知道我们所使用的docker镜像和云服务器中的脚本是否是最新的? 看到也有别的人提了相似的问题,可能在refGene,cytoBand,1000g2014oct_eur,1000g2014oct_afr,exac03,ljb26_all,clinvar_20140929,snp138中找不到的...

问题 使用tcga_gene_exp_download.r下载TCGA数据始终无法产生gene expression相关的文件 killed

这是我用docker 镜像下载完成后的数据,更换成课程使用的HNSC也无法产生表达的总结数据,更换网络也不能改善 更换网络同样无法改善 代码没做太多修改,是什么参数除了问题吗 表达的原始数据应该成功下载 运行过程: F...