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问题 你好,我不小心把镜像下载到C盘了,不小心爆盘了。有办法解决吗? windows

修改docker镜像的默认存储位置

问题 服务器超过5个线程,被killed。请问怎么使用名单规定线程?下面命令如何修改规定线程。

docker run --rm -v /home/us180/gene-family:/work -it omicsclass/gene-family:v2.0

问题 在singuarity使用gatk时调用不了HaplotypeCalle指令

... /public/software/singularity/bin/singularity exec /public/home/huangyou/docker-images/reseq-v2.0.sif gatk --java-options HaplotypeCaller -R /public/home/wangyongsheng/PepsiCo_OT3098_V2_panoat_nomenclature.fasta \ -I /public/home/wangyongsheng/oats/text/picard-bam/${i}.sorted.dedup.bam \ -O /pub...

问题 请问request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers... check if the server supports the requested API version 这个问题该怎么解决

运行docker 解析gff信息时,中断, docker软件的containers中出现 request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers/025fef2a3e783d8c473c644d58e2ffd31be5f157743e797b0649966a18031dfc/json, check if the server supports ...

问题 基于Python的mcscan的微共线性分析问题

...来,就是到了arrow和着色就不行了,想问一下,在咱们的docker里面是不是路径有问题,或者python的版本低了呢?请帮忙解答一下,谢谢了。 第一次出现问题:频率最高 第二次出现问题:

问题 新手求助,基因家族分析的第6课时,老师演示在dockerdesktop里面进行复制和解压,求一下在这之前的命令

你好,我想问一下,基因家族分析的第6课时,老师演示在dockerdesktop里面进行复制和解压,在这之前打开powershell,在里面输入的运行docker的命令是什么,

问题 基因家族分析共线性的时候没有大片段复制的基因对 正常吗

老师您好:         我是根据docker课程学习基因家族,做自己的物种,共鉴定到22个HSP70基因,,到MCScanX的时候,使用excel的vlookup函数,找到一对串联重复的基因,但是没有大片段复制的基因,作图时也没有红色的线条,,,...

问题 扩增子分析 :qiime2分析-多样性分析alpha-beta-差异比较等 课程中的问题

#添加分类信息时报错 这是用qiime2分析完数据后,再利用qiime分析时候报错 #自己用服务器进入的ampliseq-q1:v1.2使用的命令:docker run --rm -v /disk1/liuh/qiime2:/work -it omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 请老师帮忙解答一下,谢谢。

问题 hisat2中提示"/work/my_rnaseq/ref/Gmax_508_v4.0.fa" does not exist

查了路径,设置好了,也重新进入docker重设路径了,还是不想,一直提示不存在

问题 Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误,请问如何解决

Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误,请问如何解决,这个问题之前有提过,但是没有人回答,有人只是指出可以安装docker,但是需要root用户安装,没有root权限的用户怎么办

问题 请问老师,我重新修改了软链接,但是基因组序列文件和注释文件批量链接还是出错,为红色

...是这样 基因数据在这个位置,这是我新修改的软链接,docker run -it --name pangenefamily --group-add keep-groups -v ~/pan-gene-family/:/work -v /home/us367/pan-gene-family/pan-gene-family_maize/data:/work/pan-gene-family_maize/data -v /home/us367/pan-gene-family/pan_gene_list/da...

问题 基因组注释 ,seqclean软件报错

...在做基因组注释时,PASA_assembly中,seqclean报错,使用的是docker的镜像,已添加export USER='me'   报错信息如下: /work/zhushi/04.PASA_assembly/UniVec seqclean running options:  seqclean all_transcripts.fasta -c 10 -n 10000 -v ./UniVec  Standard log file: seqcl_...

问题 老师,在使用 perl ../script/get_fa_by_id.pl进行基因家族成员顺势作用原件分析与展示时程序报killed

这里用的是玉米基因组2.1G, 开始搭建镜像时docker run -m 10G --cpus 2 --rm -v C:/gene-family:/work -it omicsclass/gene-family:v1.0.1 给了10G, 然后不管是使用perl ../script/get_promoter.pl ../Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa mrna_location.txt promoter.fa还是拆...

问题 老师,您好,我按照课程安装doekcr,下载了群体遗传学的镜像,在启动镜像的时候总是显示错误,请问老师该如何解决呢?

...下载了群体遗传学的镜像,在启动镜像的时候执行指令:docker run --rm -it -m 4G --cpus 1 -v /home/share/pop-evol:work omicsclass/pop-evol-gwas:latest 总是显示Error response from daemon:failed to create task for container: failed to create shim task: OCI runtime create fa...

问题 Raw-mode is unavailable courtesy of Hyper-V. (VERR_SUPDRV_NO_RAW_MODE_HYPER_V_ROOT).

尝试安装过docker desktop,导致toolbox无法启动 Windows10无法完全关闭Hyper-V导致VirtualBox 虚拟机无法启动 Raw-mode is unavailable courtesy of Hyper-V. (VERR_SUPDRV_NO_RAW_MODE_HYPER_V_ROOT). 返回 代码:E_FAIL (0x80004005)组件:ConsoleWrap界面:IConsole {872da645-4a...