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问题 镜像安装，镜像安装

老师，您好！我尝试跟着教程执行docker pull omicsclass/pan-gene-family:v1.0命令行时根本下载不了镜像，请问一下您可以发一份本地版本镜像文件吗

问题 重测序

我在重测序call  SNP 的时候，为什么跑一段时间这个镜像就找不到了？但是任务和文件怎么还在更新？ [us001@omicsclass-a06  16:17:00 ~]$docker ps CONTAINER ID  IMAGE       COMMAND     CREATED     STATUS      PORTS       NAMES

问题 kaks转换报错

老师，您好！ 我目前是在docker的bio-linux里操作的，我在做aln转换axt格式时老师报错，请问如何解决。说是没权限，但是我已经再root里面给了777权限，但还是报错。

问题 镜像加速接下来怎么操作

看了docker在windows系统和mac系统中安装 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)这个帖子，但页面不一样，不知道接下来怎么操作，求解答，感激。

问题 为什么启动不了镜像？

docker run -it -m 3G --cpus 1 --rm -v D:/reseq:/work omicsclass/reseq:v1.1 这条命令启动不了镜像这是为什么？输入进去以后就会报错invalid option type work

问题 运行ggtree.r报错permission denied!

在gwas的docker中运行进化树作图脚本ggtree.r报错-Permission denied

问题 sqlite数据库 配置

老师好，如果使用sqlite数据库，一开始进入注释容器的时候，怎么配置呢？  需要 link 吗 docker run -it --rm --name annotation -v /home/super/Desktop/:/work --link "mysql_pasa:mysql" omicsclass/genome-annotation

问题 想要bsa分析和绘图的脚本

两个亲本两个子代，我想自己从vcf文件开始分析，之前报了那个49.9的bsa课程，但主要是从docker中操作，我想用R进行分析，我想咨询怎么才能得到那个脚本，很喜欢做出来的那个图。。。。

问题 动植物基因组组装

...序列的组装，sh中设定scripts的目录在/work/scripts/中，但我docker pull的基因组组装镜像中没有这个目录，目录结构如下/shar/work/biosoft.  没有scripts这个目录。导致流程中提到的很多脚本无法找到，请您们确认下，谢谢！

问题 重复序列注释的问题

求助老师，在用docker镜像进行重复序列注释中，出现如下错误，请问老师该怎么解决： Reading liftover chains Couldn't open /work/data/genome.chain , No such file or directory 另：在一次全部运行 01.Repeat.sh时，如果中间出现报错，是要重新运...

问题 老师您好，下载镜像失败显示这个该怎么解决？

Error response from daemon: Get "https://registry-1.docker.io/v2/": net/http: request canceled while waiting for connection (Client.Timeout exceeded while awaiting headers)

问题 fasttree 建树时没有找到这个软件

在用你们的docker建树时fasttree软件没有运行，报错如下： [us002@omicsclass-a02  16:47:41 ~/pop/pop_cucu_demo/01.phylo_tree]$fasttree -nt -gtr  supergene.phy   >  fasttree.nwk-bash: fasttree: command not found

问题 MYSQL做pasa_update的时候报错

老师您好，我用的docker，做基因组注释到pasa_update 的时候报错了，请问怎么解决呢？麻烦老师了

问题 想做GWAS练习,但进入不了助学大讲堂的镜像

打开Putty,使用组学账号(us082)登陆后想做GWAS,但是到docker run命令那执行不了,进不去了

问题 在进行物种累积丰度曲线时提醒没有该命令

 species_accumulation_curve.r  -i $workdir/4.export_data/feature_table_tax_rare.txt  \         -n species_accumulation_curve 是docker·镜像里没有装r吗