求助:叶绿体基因组测序深度覆盖图的画法以及相关脚本。

attachments-2024-02-FMRIrkoO65e0781a11b6e.png类似于这种测序深度图,请问怎么做出来

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1 个回答

星莓 - 生物信息工程师

在叶绿体课程中的《组装质量判定》这节课中有详细说明。       主要是将叶绿体序列与原始fq数据进行比对,得到bam文件,之后再用samtools depth功能得到每个位点的深度,用excel或者R语言作图即可。

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