老师，在学习扩增子高级分析群落数据co-occurrence network分析，运行代码network=net_pro(igraph) 出现报错 Error in average.path.length(igraph) : At core/paths/shortest_paths.c:188 : Weight vector must be non-negative, got -0.509662. Invalid value - 组学大讲堂问答社区

老师，在学习扩增子高级分析群落数据co-occurrence network分析，运行代码network=net_pro(igraph) 出现报错 Error in average.path.length(igraph) : At core/paths/shortest_paths.c:188 : Weight vector must be non-negative, got -0.509662. Invalid value

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3 个回答

xun - 电路元件工程师 2022-12-12 16:46

这个主要是因为igraph更新以后权重向量不能为负了，而我们代码里的筛选条件筛出来的数据有一个负值，只需要提高一下条件就好了，把数据设置成截图里的就行

换成自己的数据也是一样的，先是用原来的参数跑，如果报了同样的错误，就适当提高参数

糖葫芦 2022-10-22 14:34

同学你这个问题解决了吗，我现在也遇到了

makuojian 2022-11-29 21:37

请问解决了吗。我也是这个问题。

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黑暗的另一边提出于 2022-05-03 22:23