5 如何在KEGG代谢图上标记基因上下调?

一些文章中有显示KEGG代谢通路中基因上下调的图,请问这样的图,如何绘制?

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最佳答案 2018-07-22 07:00

这个可以采用KEGG Mapper  按照下图3步来完成。
attachments-2018-07-5EtRVv0m5b3c26a94dc6a.jpg

1. 如果研究的物种,在KEGG中有注释,那么输入  基因的名称 + 颜色  即可

2. 如果该物种在KEGG中没有注释,则需要采用KEGG的 KAAS进行比对注释,获得基因对应的KO号。 输入KO号 + 颜色  


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