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群体结构clean.vcf.gz转换成phy文件失败
正常情况下，是会输出文件supergene.phy的。如果你是使用自己的vcf文件的话（因为课程提供的案例vcf.gz文件是比较小的，我试过没有问题），有几种方案你可以尝试一下：1. -Xmx5G参数改成 -Xmx25G（如果你使用自己的比较大的vcf文件，这个参数的更改非常重要）2.服务器或者本地电脑自己下载tassel工具，同时不用打开镜像，使...
回答于 6天前
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在做GWAS关联分析，利用gapit软件报错
请问同学， cannot open file '/biosoft/GAPIT3.0/gapit_functions.txt': No such file or directory Execution halted这个问题后来时如何解决的呢？我也遇到了同样的问题
回答于 2024-01-28 18:12
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Tassel进行自己的GWAS分析中，自动分析pca时，不生成pca1~3文件...
直接在命令行降低了-Xmx参数：结果有了一点变化： 下边提供了解决方案，我先试试。把java堆内存大小设置到100G，就可以运行了。
回答于 2024-01-27 09:35