Invincible
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最近动态

2022-04-08 09:46 发起提问

老师您好，我问过我们这边的一个老师，他是直接用的我的plink_pca.eigenvec文件直接在R绘制的，并且没有用我的分组信息，直接PCA就可以做出来图，他说可能是我的分组有点问题，但是我用这个分组可以完成进化树和structure绘图，做PCA的图却

2022-04-06 21:11 发起提问

老师您好，我的项目是对一种昆虫的六个不同的土著种进行重测序分析，每个土著种只有一个样品，也就是说我一共只对6个样品进行分析，我目前买了咱们群体结构分析的课程，pca分析好像不太适用于我这么少的样品，想请问老师我除了群体结构分析里的内容还可以针对哪些内容进行

2022-04-06 21:01 发起提问

老师您好，我在进行连锁不平衡分析时，在这一步遇到了问题，这是什么原因呀，我的分组是这样的，是不是因为我的每个分组里只有一个样品才不行呀

2022-04-05 21:31 发起提问

老师您好，我在用iqtree绘图和pca绘图这里都遇到了行列数量不同的情况，但是我的分组是这样的，这个要怎么解决呀

2022-04-04 16:09 发起提问

老师您好，我在fasttree构建系统发育树这一步，程序会被kill掉，看不到报错，前面的程序运行的都没有问题，唯一的一处报错出现在给vcf文件排序这里，但是这一步生成文件了 而且下一步转换格式也没有问题，这个该怎么解决呀

2022-04-04 15:55 回答问题

老师您好，群体结构分析自己的数据时，进行到文件格式转换那一步遇到了问题，报错写的是要将vcf文件正常排序，我自己在网上找到了相应的脚本，却不能正常运行，报错写的是不能生成JAVA虚拟机，我的脚本是不是有什么问题呀，这个应该怎么解决呀

我自己弄明白了，1536m后面少了个空格

2022-04-02 21:18 发起提问

老师您好，群体结构分析自己的数据时，进行到文件格式转换那一步遇到了问题，报错写的是要将vcf文件正常排序，我自己在网上找到了相应的脚本，却不能正常运行，报错写的是不能生成JAVA虚拟机，我的脚本是不是有什么问题呀，这个应该怎么解决呀

2022-03-26 18:42 发起提问

群体结构分析课程中文件格式转换这一步按着课程代码输入怎么也不成功，这是为什么呀