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请问老师为何绘制snp密度图报错？
回答于 2023-10-25 22:08
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perl脚本去除重复的hmmer搜索的转录本ID为一行，且结果ID是蛋白...
按照脚本：ID保持一致,也就是gff中第9列，ID标签和parent标签与蛋白序列和cds序列里面的ID一致；#处理GFF 文件里面ID与蛋白质中的ID保持一致 那我： 1.修改gff文件加上：“.1” 将就蛋白ID 和 CDS ID 可以吗？ 2.还是将蛋白ID的“.1”全部删除？
回答于 2022-10-24 13:06
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BLAST 比对建库
老师，您误会了。因为我的目标物种没有pfam号，所以我用已知人类的蛋白序列建立种子序列，分析结果如上所示。通过前期的文献积累，比对结果符合该基因家族的特征。 目前的主要困惑是：（1）在CD-search 里面，Incomplete出现N/C/NC端不完整的片段，是直接从XXXX.fa里面删除整条ID对应的序列还是保留分析？...
回答于 2022-10-07 22:27