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2021-12-07 13:52 发起提问

情况是这样，去年我测了一个转录组，当时我做的物种还没测全基因组，也就是当时是无参的情况，今年最近该物种的全基因组数据发布了，我在全基因组中做了一个基因家族的分析，然后想在去年测得转录组中找到全基因组中相对应的基因，然后看其表达量，能否通过简单blast实现

2020-03-07 00:52 回答问题

各位老师好，我在做拟南芥紫色酸性磷酸酶基因家族分析，该家族中有29个相关基因，我通过pfam 数据库关键词搜索得到一个检索号，然后下载后通过hmmsearch 分析，但结果只有25个相关基因，请问是怎么回事？问题出在哪里？

我怎么做才能找到29个相关基因？

2020-03-07 00:52 发起提问

各位老师好，我在做拟南芥紫色酸性磷酸酶基因家族分析，该家族中有29个相关基因，我通过pfam 数据库关键词搜索得到一个检索号，然后下载后通过hmmsearch 分析，但结果只有25个相关基因，请问是怎么回事？问题出在哪里？