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因为现在安装的blast+的版本太高,所以里面没有blastall这个,那基因家族分析中共线性分析的下面这个用到的命令,怎么修改成blastp或者blastn的脚本方式
1/2774
2021-02-04 23:31
MEME就运行脚本的时候,其中的maxsize 指最大输入文件的字符数,maximum dataset size in characters,这个是指多少b吗,6000000是指文件最大6M,单位是什么?时间的最大值单位是秒吧?,motif的个数最小长度一般是多少?有什么参考的吗,最大长度是多少,这个长度的单位是什么,多少b,还是多少kb?
1/3796
2021-01-27 21:28
在基因家族分析过程中,确定结构域的时候发现一个算是该基因超家族但不是该基因家族的成员,那这个算是该基因家族的成员吗
1/3717
2021-01-12 10:16
如果利用基因来批量提取一批基因的蛋白序列,结果提取的结构域文件中,发现并不是全部的基因都提取出了序列,那么怎么查找或者说获取这些没有提取到序列的基因是那些
1/2934
2021-01-04 16:16
有了基因的ID后,如何批量获取这些基因的染色体所在,以及这些基因的起始位置
1/4519
2021-01-04 16:06
基因家族分析,用CDD确认结构域的时候,根据统计的表格,怎么找到那些未匹配到相应结构域的基因或者序列是哪个?
1/4149
2021-01-01 00:22
在基因家族分析的时候,结构域的筛选E-value值的时候,选取小于0.0001,运行命令,结果中并没有排除掉一些大于该值的序列,3.4e-05到底等于多少,是3.4乘以e的-5次方还是3.4e的10的-5次方
0/4490
2020-12-30 19:59
基因与mRNA的对应关系(两个,一个mRNAid_to_geneid,一个geneid2mRNAid),两个文件一般都是相等,那不相等的话意味着什么呢?
1/2762
2020-12-14 21:06
Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误,请问如何解决
2/3219
2020-12-13 18:48
怎么在linux服务器上安装bioperl,以及Bio:SeqID 模块,非root权限
1/3921
2020-12-10 10:30
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