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run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess clean.sorted.vcf.gz \ -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这条代码跑不出来,报错原因如图所示,
0/53
3天前
putty打开没反应
1/228
2025-05-21 19:26
我的fasta文件是由scaffold组成的,不是直接的A01和C01之类的,然后我现在用现有的文件以Gapit方式跑曼哈顿图时报错,该怎么调整
1/235
2025-05-21 15:00
Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r -i pvalue_$m.txt -F $FAI -T Sugar_$m -n Sugar_${m}_manhattan -c 1.3e-6绘制曼哈顿图时,输入这段代码后,报错,显示颜色数量不足,怎么解决
2/301
2025-05-15 16:19
Rscript $scriptdir/gapit_gwas.r -i /work/hapmap.txt.gz -t /work/Sugar.txt -m GLM -n hd.GLM.GWAS.Results 就是我执行完这个命令,一直在这个界面,等一个多小时都没反应,hapmap文件大小260M,是还在运行,还是哪里错了
1/261
2025-05-14 22:56
perl $scriptdir/vcf2hmp.pl all_clean.vcf.gz hapmap.txt.gz始终显示找不到脚本,但脚本在我设置的路径中,不知道该怎么解决
2/260
2025-05-13 13:47
bash:docker:command not found是什么情况,还有就是根据我这个目录如何运行docker run --rm -it -v /share/work/huangls/piplines/omicsclass/pop-evol-gwas/scripts/:/work/scripts -v /share/nas1/huangls/test/gwas_rice:/work omicsclass/pop-evol-gwas:v2.0这条命令,怎么进行修改
2/257
2025-05-12 19:51
在容器中设置工作路径始终显示找不到内容,调整好多次了,还是不行
2/402
2025-04-29 15:29
我想把vcf文件转换为hapmap文件,一直跳出来这个提示,是什么原因
1/300
2025-04-28 17:58
图1是用命令查询了,图2就是遇到的问题,文件始终显示无法启动传输,但有几个已经传输成功了
1/876
2024-10-28 18:28
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