看基因组挺大的,放后台过几十分钟再看看。
我做的是大麦Hordeum_vulgare品种的数据准备,但是当我输入
#提取cds序列
/share/work/biosoft/TransDecoder/latest/util/gff3_file_to_proteins.pl --gff3 $species.longest_isoform.gff3 --fasta $genome --seqType CDS >$species.cds.fa
#提取pep序列
/share/work/biosoft/TransDecoder/latest/util/gff3_file_to_proteins.pl --gff3 $species.longest_isoform.gff3 --fasta $genome --seqType prot >$species.pep.fa
这两个口令的时候程序没有任何反应,我等很久都没有反应,但是放后台拉过来也能看到是显示在running。但是试了很多次也都没有跑成功不知道是那里出了问题
请老师解答!感谢