在容器里运行其他命令的时候没有出现这个问题吗？

这个提示的是容器检查点（checkpoint）功能的配置，默认配置下，检查点操作每 60 秒执行一次。如果容器写入频繁、磁盘 I/O 压力大、 60 s不足以完成检查点操作就会导致操作中断。

这个需要改/etc/docker/daemon.json的内容，还要重启容器。
使用Docker Checkpoint功能提升容器化应用性能与容错能力的开源项目实践 - 云原生实践

您好，目前运行其他命令没有出现这个问题，直到运行iqtree2才报错。请问怎么修改/etc/docker/daemon.json的内容呢，我这里修改不了吧，没有这个文件，执行“less /etc/docker/daemon.json”，显示“/etc/docker/daemon.json: No such file or directory”。感谢再次解答！