无论是下载下来的该物种的全部代谢物,还是公司检出的,只要是识别到有ko号的,都可以放进来。
还有最终会生成富集分析结果表07.KEGG_enrichment_result.csv,里面有P值、矫正后的q值。一般P值就可以,如果想在绘图中展示q阈值结果,可以简单修改一下脚本。