5 想请教下,就是我测了种子五个不同发育时期的转录组,想通过转录组数据中的表达量筛选出几个候选内参基因,用什么条件筛选呢?

我是通过所有基因FPKM值得文件进行筛选的,目前知道的是①CV小于0.15,②两个时期比对log2(fold change)绝对值小于0.2,筛选出了四百多个基因,还有什么条件可以筛选呢?比如FPKM值介于多少比较好?

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

内参基因都是通用的,稳定表达的基因就可以,可以参考:http://www.omicsclass.com/article/110

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  • Mostly Clear 提出于 2019-01-10 11:11

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