问题 老师您好，我想请问一下下面这个热图用R语言绘制（我买的是您这里的“R语言基础绘图这门课”，用的是pheatmap)，请问一下color这个参数如何设置才能和这个图的一样呢，因为一般都是设置col=c("blue","white","red"), 其它的像下图这种颜色是如何得到的呢

问题 老师，我在重新描述一下问题，mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对，数目不一样，是不同算法的不同结果是吗？做CIRCOS时， 可以用BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对来做吗？我BLAST方法筛出来的串联重复等数目更多一些。

问题 蛋白三级结构分析时，用PSI-blast和SWISS-MODEL自带的模板同时做了，发现SWISS-MODEL自带的模板做出来的相似度更高、GMQE和QMEAN值也更好，同时，两个方法也有重复的模板，想问问老师应该选择相似度更高的，还是选择两种方法都有的模板？

文章 SCI期刊版面费一般是多少？为什么这么贵？要自己出钱吗？

...你是在查不到的话，可以随时来问学霸姐姐~ 学霸姐姐捧不了钱场，捧个人场还是可以的哦！ 生物女学霸，一个自称学霸其实很渣的生物汪，努力将有趣的、有用的、有血有肉的科研那些事儿呈现给大家，关注一个好不啦~

问题 lncRNA分析结果中，和参考基因组的比对效率比较低，那么我在发文章过程中，审稿人会有异议么？

问题 请问怎么找出基因组序列中所有基因的起始终止位置，或者怎么从基因组或者什么文件中找到某些基因的起始终止位置

问题 老师，您好，请问string数据库中没有丹参，可以选择物种为拟南芥，然后根据同源蛋白推测丹参中的互作蛋白吗？

文章 endnote 插入文献 变成临时 大括号{} 不自动更新文献

用endnote在word中插入文献时突然 会出现{Garcia-Mas,2012 #1387} 无效格式大括号，或者变成临时文献插入，如下图 其实很简单，只需要选好style，再更新一下Update Citations and Bibliography，就可以了如下 更多生物信息课程： 1. 文...

问题 群体遗传课程admixture的问题

用课程测试的数据运行admixture的时候，显示segmentation fault. 因为docker镜像omicsclass/reseq里面没有找到admixture，所以用conda install另外安装了admixture。我用docker其他镜像的admixture，也是不行，还是显示segmentation fault。

问题 请问，有些文献中，给出的KME值，在WGCNA教程中，生成的"10_GS_and_MM.xls"文件中，哪个和它是对应的？比如下图所示。文献链接如下：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5429000/

问题 老师，我在重新描述一下问题，mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对，数目不一样，是不同算法的不同结果是吗？做CIRCOS圈图时， 可以用BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对来做吗？我BLAST方法筛出来的串联重复等数目更多一些。

问题 阈值中有效SNP的计算

我们GWAS课程中的阈值设置是0.05/total SNP 或者1/total SNP，但是文献中一般都是用Genetic type 1 Error Calculator (GEC)软件计算出有效的SNP个数，再计算阈值？这个在咱们课程怎么没有提及？

问题 N50多少，证明组装的好？这篇由SXR写的文章中的下图是哪一篇文献中的，求文献题目

该图在此文章中，是genome size 和 gene size 的对数对应关系图

问题 bandage中节点的深度

问题一：在bandage中节点的深度有500X，但实际上我的测序数据只有30X，为什么bandage中和实际的深度是不同的呢？ 问题二：在bandage中，不同节点的测序深度差别很大，最低的深度有500X，最高的深度有5000X，请问是什么原因造成了...

问题 老师好，在基因家族分析课程视频里，鉴定基因家族成员时，里面实操用的是基因组的蛋白质序列（pep文件），然而我自己的实验数据是无参转录组，我想问下，我应该用什么文件来鉴定基因家族成员呢？我看到之前有类似问题的答案是unigene或者蛋白质序列，两者有什么区别呢？

基因家族成员鉴定