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问题 你好老师，我想问下转录组数据，有五个不同的处理，每个处理3个重复，一共15个样本，可以做WGCNA吗？

问题 老师，我利用circos做基因共线性绘图时，第一步准备绘图数据文件时为什么生成的两个文件是空的？

问题 老师，我利用circos做基因共线性绘图时，第一步准备绘图数据文件时为什么生成的两个文件是空的？

问题 PASA组装转录本时候报错，既不能创建也不能删除数据库

DBD::mysql::db do failed: Can't drop database 'mydb_pasa'; database doesn't exist at /share/work/biosoft/PASApipeline/PASApipeline-v2.5.2/PerlLib/DB_connect.pm line 222. DBD::mysql::db do failed: Can't create database 'mydb_pasa'; database exists at /share/work/biosoft/PASApipeline/PASApipeline-v2....

问题 请问老师，用多个物种的转录组pep数据可以进行比较组学中基因家族聚类、扩张收缩等的分析么？

问题 老师您好 ，我在使用DESeq包时，将我的数据从非整数变成整数后依旧没法用DESeqDataSetFromMatrix函数，这是什么原因呢

问题 老师您好 我用tassel软件跑MLM模型时，按照程序跑了好几遍一直报错，检查了数据没有问题，期待老师解答

问题 用iTOL美化进化树时出现如下问题，求解答。

对分支颜色修改以及拖拽数据进去时都会出现右上角红框所示，无法保存修改的东西，拖入数据显示无法找到对应ID,自己的数据和实例数据都是如此，希望高手解答，谢谢。

问题 诱变材料且以自交M6代，可不可以采用 QTL-seq 的方法来定位到基因？

...tmap 方法需要自交，所以感觉比较费时间，而 QTL-seq 可以筛选到表型后直接混池测序，所以想搞清楚，如果是诱变材料，且诱变材料也自交了M6/M7代 可不可以 用 QTL-seq 分析？为什么？静等老师回复，非常非常感觉您的帮助！

文章 GSDS指定序列顺序

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树mcmctree

...树 ln -s ../03.Phylo_Tree/raxml.cds.raxml.support species.tre #准备数据 ln -s ../03.Phylo_Tree/single_copy.cds_msa.4d.fasta . ln -s ../03.Phylo_Tree/single_copy.cds_msa.fasta . ln -s ../03.Phylo_Tree/single_copy.pep_msa.fasta . #格式转换 trimal  -in single_copy.cds_msa.4d.fast...

文章 Adobe Illustrator启动失败

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 An introduction to PERMANOVA and ANOSIM

...SIM（Analysis of Similarities）都是用于分析和比较群组间多元数据差异的统计方法。它们特别适用于生态和环境科学领域，但也可应用于其他需要分析复杂数据集的科学研究。这两种方法都使用排列测试来评估群组间的差异，但在具...

问题 想咨询一下各位老师，宏基因组注释的时候，我有总共160G的土壤宏基因组数据(21个样本)

想咨询一下，想注释出来那些样本，使用附赠的课程里的3个月的服务器，能不能带的动？谢谢

文章 人类miRNA-mRNA 与 miRNA-lncRNA 靶向数据库总结

The experimentally verified miRNA-mRNA pairs were downloaded from starBase v3.0 (18), DIANA-Tarbase v8 (19), miRTarbase (v7.0) (20) and miRSponge (21) databases, while the experimentally validated miRNA-lncRNA pairs were extracted from starBase v3.0 (18), LncACTdb2.0 (22), DIANA-LncBase Experimental...