问题 请问老师，用多个物种的转录组pep数据可以进行比较组学中基因家族聚类、扩张收缩等的分析么？

问题 老师您好 ，我在使用DESeq包时，将我的数据从非整数变成整数后依旧没法用DESeqDataSetFromMatrix函数，这是什么原因呢

问题 老师您好 我用tassel软件跑MLM模型时，按照程序跑了好几遍一直报错，检查了数据没有问题，期待老师解答

文章 R语言中转换成dummy dummy-variables 虚拟变量

了解虚拟变量 DUMMY VARIABLE 在数据分析中，利用回归模型来寻找变量间的关系是广泛应用的一种数据分析方法。通常情况下，回归分析中变量都是定量数据，原因是模拟回归需要样本数据。然而在实际的操作中，模型中只考虑定...

问题 用iTOL美化进化树时出现如下问题，求解答。

对分支颜色修改以及拖拽数据进去时都会出现右上角红框所示，无法保存修改的东西，拖入数据显示无法找到对应ID,自己的数据和实例数据都是如此，希望高手解答，谢谢。

文章 GSDS指定序列顺序

...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 Adobe Illustrator启动失败

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问题 想咨询一下各位老师，宏基因组注释的时候，我有总共160G的土壤宏基因组数据(21个样本)

想咨询一下，想注释出来那些样本，使用附赠的课程里的3个月的服务器，能不能带的动？谢谢

文章 人类miRNA-mRNA 与 miRNA-lncRNA 靶向数据库总结

The experimentally verified miRNA-mRNA pairs were downloaded from starBase v3.0 (18), DIANA-Tarbase v8 (19), miRTarbase (v7.0) (20) and miRSponge (21) databases, while the experimentally validated miRNA-lncRNA pairs were extracted from starBase v3.0 (18), LncACTdb2.0 (22), DIANA-LncBase Experimental...

文章 seqkit计算基因组大小

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文章 An introduction to PERMANOVA and ANOSIM

...SIM（Analysis of Similarities）都是用于分析和比较群组间多元数据差异的统计方法。它们特别适用于生态和环境科学领域，但也可应用于其他需要分析复杂数据集的科学研究。这两种方法都使用排列测试来评估群组间的差异，但在具...

文章 利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树mcmctree

...树 ln -s ../03.Phylo_Tree/raxml.cds.raxml.support species.tre #准备数据 ln -s ../03.Phylo_Tree/single_copy.cds_msa.4d.fasta . ln -s ../03.Phylo_Tree/single_copy.cds_msa.fasta . ln -s ../03.Phylo_Tree/single_copy.pep_msa.fasta . #格式转换 trimal  -in single_copy.cds_msa.4d.fast...

文章 Perl语言里面$.代表什么意思

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文章 PLoS One好投吗？听说必须要提供WB原始数据？

...场调查等都有自己严格的标准; 2，所有PLoS手稿必须包含数据公开性声明，还建议作者在出版前将其数据提供给公共数据库; 3，从2018年开始，开启“大撤稿模式”，2019年上半年已经撤稿20多篇，预计未来投稿会更严。 所以，PLo...

文章 蛋白质组与转录组的关联分析如何做？

...找某些关键的代谢通路或者调控因子； 3、对于一些蛋白数据库不完整的物种，通过转录组数据构建蛋白质库，可以大幅度提高蛋白质的鉴定数。 然后，材料选取上需要注意什么？ 根据研不同的究目的，选取不同处理的样本...