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问题 老师,我想问一下为什么我的共线性分析的圈图一半有数据,一半没有呢 circos

问题 买的转录组教程。rnaseq镜像里面enrichKEGG_pip.R示例数据提示no gene mapped

问题 老师,根据遗传进化课程做LD,测试文件和我的数据输出的文件都是空的,这是什么问题呢?

问题 使用Bwa mem命令时,使用-M和不适用时候,对后续数据分析有影响?是否需要加-M?

问题 在singularity中复现遗传进化中数据过滤时出现以下信息导致clean.vcf.gz大小不符合demo

问题 已经发表的文章用的是两个隐马尔可夫模型,怎么样把搜索出来的数据合在一起呢?

问题 #16S 分析 deblur的方法应用时报错,如下图,前面的数据是严格按照视频进行的,请老师解答

问题 t2t基因组,转录组数据注释

课程实操中只用了一组转录组数据,如果有多个不同组织的二代转录组,如何分析?,以及一个混样品的三代转录组数据(用教程Trinity中单独分析代码吗),二代和三代转录组数据如何整合呢? mkdir 18.PASAcd 18.PASAln -s ../14.Repeat/...

问题 果实发育时期的转录组热图中,有几个基因在各个时期均表现低FPKM值,请问是转录组数据有误吗?

...达。 请问这种情况,有什么可能原因呢,是由于转录组数据有误、或是基因有误吗?我该怎样检查呢? 请老师指导!

文章 R语言基础入门—因子

在R语言当中有因子这个特殊的数据结构,和别的编程语言不同,这个数据结构的主要目的是用来分类,计算频数和频率,在后期将R语言用于统计学当中将会十分受用。并且在绘图当中,我们使用同样的数据,将其转化为因子之...

文章 ValueError: invalid literal for int() with base 10: ''

...基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提...

问题 请问一下做WGCNA时,出现这种问题如何解决呢?用的是课程的数据

traitColors = numbers2colors(datTraits, signed = FALSE) Warning message: In numbers2colors(datTraits, signed = FALSE) : (some columns in) 'x' are constant. Their color will be the color of NA. > # Plot the sample dendrogram and the colors underneath.

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 葡萄膜黑色素瘤 (UM) 是一种高度转移性癌症,与皮肤黑色素瘤相比,它对检查点免疫疗法基本上没有反应。在这项研究中,我们使用来自 8 个原发性样本和 3 个转移性样本的 59,915 个肿瘤和非肿瘤细...

文章 iTOL绘制好看的系统发育树

...字体等常规编辑,更能导入不同的注释信息,展示更多的数据信息。iTOL网站地址:http://itol.embl.de/login.cgi iTOL使用方法 使用iTOL需要先注册,然后就可以登录。 之后导入进化树文件,如MEGA软件生成的Newick文件,Sample project中...

问题 甲基化数据注释表看不懂怎么办? 如何理解每一列对应的生物学含义?提前感谢!

这是下载下来的表格!