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问题 下载甲基化数据时找不到样本类型,

...##############################################> # 1. 下载TCGA甲基化数据> ############################################################> # 查询需要下载的甲基化数据(本次分析只下载肿瘤样本)> query.met <- GDCquery(project = tcga_project, +          ...

问题 t2t基因组,转录组数据注释

课程实操中只用了一组转录组数据,如果有多个不同组织的二代转录组,如何分析?,以及一个混样品的三代转录组数据(用教程Trinity中单独分析代码吗),二代和三代转录组数据如何整合呢? mkdir 18.PASAcd 18.PASAln -s ../14.Repeat/...

问题 请问一下,当用时期作为表型数据时,文件该是什么格式?行和列各怎么赋值,还有就是重复间要不要区分?

问题 OMIM数据库位置信息是hg19/GRCH37还是hg38/GRCH38为参考的?

What reference assembly does OMIM use for the genomic coordinates?

问题 各位老师,请问一下DEseq2差异基因分析所用得到数据是expected_count值,还是FPKM值啊

问题 老师,我想问一下为什么我的共线性分析的圈图一半有数据,一半没有呢 circos

问题 买的转录组教程。rnaseq镜像里面enrichKEGG_pip.R示例数据提示no gene mapped

问题 老师,根据遗传进化课程做LD,测试文件和我的数据输出的文件都是空的,这是什么问题呢?

问题 使用Bwa mem命令时,使用-M和不适用时候,对后续数据分析有影响?是否需要加-M?

问题 在singularity中复现遗传进化中数据过滤时出现以下信息导致clean.vcf.gz大小不符合demo

问题 已经发表的文章用的是两个隐马尔可夫模型,怎么样把搜索出来的数据合在一起呢?

问题 #16S 分析 deblur的方法应用时报错,如下图,前面的数据是严格按照视频进行的,请老师解答

文章 R语言基础入门—因子

在R语言当中有因子这个特殊的数据结构,和别的编程语言不同,这个数据结构的主要目的是用来分类,计算频数和频率,在后期将R语言用于统计学当中将会十分受用。并且在绘图当中,我们使用同样的数据,将其转化为因子之...

问题 果实发育时期的转录组热图中,有几个基因在各个时期均表现低FPKM值,请问是转录组数据有误吗?

...达。 请问这种情况,有什么可能原因呢,是由于转录组数据有误、或是基因有误吗?我该怎样检查呢? 请老师指导!

文章 ValueError: invalid literal for int() with base 10: ''

...基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提...