问题 老师，用GSDS２.０把基因结构和保守基序绘在同一张图里（像下面那张图一样），“Gene Features （基因位置信息）”和“Other Features to Display (保守基序)”需要以什么样的格式输入呢？

问题 Gemma做GWAS的时候，用Gemma自带的文件运行时， mv ./output/kin.sXX.txt . 这步出错了，提示mv: cannot stat ‘./output/kin.sXX.txt’: No such file or directory

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文章 生成OTU方法如何选择，OTU/ASV?

...推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF  微生物多样性分析中最重要的就是OTU特征表，一切后续分析都围绕OTU表来进行。生成OTU除了聚类的方法，还有降噪的方法。本文分析DADA2、Deblur、Unoise3共三种降噪方法的异同点。 1DADA2 Callaha...

文章 转录组分析基因注释常用的数据库

...据库，包含的信息很全面, 注释到的基因较多。 2、COG ：中文释义即“同源蛋白簇”。COG 分为两类，一类是原核生物的，另一类是真核生物。原核生物的一般称为 COG 数据库；真核生物的一般称为 KOG 数据库。 3、SWISS-PROT：经过...

文章 空间代谢组学|质谱成像技术原理解读

...aging，MSI）和代谢组学（Metabolomics）技术，对动/植物组织中代谢物的种类、含量和空间分布进行精准测定的技术，扩展了代谢组信息的维度，对生命科学的功能研究具有重要意义。得益于质谱仪器成像分辨率和检测灵敏度的提高...

问题 想请教老师热图里的Row-z-score和Column-z-score分别是如何计算。我的数据热图用Row-z-score画完结果显示与实际数值不大对，选column好像才对。

问题 GDCdownload(query = query, directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client')下载TCGA数据时出现In if (grepl("^https?://", url)) { : 条件的长度大于一，因此只能用其第一元素 错误，数据下载不下来

问题 老师，想问一下您，用blastp方法做基因家族成员鉴定时，鉴定到了51个成员，其中有几个成员的蛋白序列相似性大于98%，但是位于不同染色体上，这种是否需要删除多余的，只保留一条就够了？

问题 关于动植物基因组组装课程中关于重复序列注释的问题

动植物基因组组装课程，01.Repeat.sh中有几个问题： 1、 第175行：#deepTE 分类根据https://www.jianshu.com/p/85e54962e2bc一文介绍，先用DeepTE_domain.py对保守domain进行鉴定，再用DeepTE.py借助上一步的保守domain信息分类TE。课程中没有对保守结...

文章 Docker 使用容器来创建更新镜像

....1.1 b1829eb2e483c9d353dd8cd21da9bf2f530bd38ccf5a95e08944a887ec856e99命令中，指定了要提交的修改过的容器的ID、目标镜像仓库、镜像名。commit提交的知识创建容器的镜像与容器的当前状态之间的差异部分，很轻量。查看新创建的镜像：$ docker i...

问题 我有一组数据想做个heapmapper热力图，您能帮我处理一下吗，我打开网址不会用，1为想关性，2为显著性

                   Mn Zn Cu Pb Cd As Hg 1 -0.661 -0.675 -0.227 -0.67 -0.623 0.072 0.027 2 0.004 0.003 0.381 0.003 0.008 0.784 0.919 3 -0.662 -0.685 -0.327 -0.721 -0.612 0.286 -0.081 4 0.004 0.002 0.2 0.001 0.009 0.265 ...

文章 单次与多次跨膜蛋白的特点和功能：多次跨膜蛋白的意义

...障，但是大多数膜的功能其实是由膜蛋白完成的。在动物中，蛋白质约占大多数质膜质量的50%，其余是脂质加上糖脂和糖基化蛋白中相对较少的碳水化合物。然而，由于脂质分子比蛋白质小得多，细胞膜通常含有的脂质分子大约...

问题 老师，您好！打扰您了。我想问一下这个问题如何解决：我第一次用GSDS网页修改好第一个基因结构图后，再修改第二个时，点击编辑后，出现的页面却是第一个基因（已经标记好的），请问如何消除记录呢

问题 老师，请问，用Evolview美化进化树时，在添加background colors for leaf labels，提示error: error: at least one valid colorset data should be given; data not upload/ updated是什么原因呢