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文章 R语言基础入门—数据结构(1)

...矩阵和数据框,数组, 列表,因子等,主要是线性代数的一些概念。 向量 向量是最基本的R数据对象,有六种类型的原子向量。它们分别是逻辑型(logical),整型(integer),双精度型(double),字符型(character),复数...

问题 vcftools 过滤等位基因。 老师,的同样是vcftools过滤indel snp后生成的vcf.gz,然后进行等位基因过滤,生成文件很小是为啥啊,我看过滤条件也不严格啊

vcf.gz是1.5G,等位基因过滤生成个900多B的文件,感觉不是想要的东西

问题 重测序

...参数的都是参照的课程的默认的。请问是什么问题呢?为啥会出现这种情况?我接下来具体调整哪些步骤的哪些参数呢?麻烦说的详细一些

文章 U盘安装 CentOS 注意问题

...inux dd nomodeset quiet initrdefi /images/pxeboot/initrd.img 然后 使 Ctrl+X 执行上面修改后的启动项,屏幕上就出列出硬盘设备的详细信息,就可以从找到U盘的盘符。再次修改 grub 条目:setparams 'Install CentOS Linux 7' linuxefi /images/pxeboot/vmlinuz...

文章 linux查找包含指定内容的文件

查找包含指定内容的文件就是grep这个命令 grep 'name' -r / grep '指定内容' -r 目录 上述命令就是在根目录下递归查找包含name内容的文件     -r 递归查找文件     -e 从文件内容查找与正则表达式匹配的行     –i 查时不区分...

文章 linux解压打包命令大全 tar gzip rar 等等

...。  tar -uf all.tar logo.gif 这条命令是更新原来tar包all.tarlogo.gif文件,-u是表示更新文件的意思。 tar -tf all.tar 这条命令是列出all.tar包所有文件,-t是列出文件的意思 tar -xf all.tar 这条命令是解出all.tar包所有文件,-x是...

文章 R语言基础入门—运算符!

...运算符,共以下5种类型的运算符。 运算符的类型 R语言拥有如下几种运算符类型: 算术运算符关系运算符逻辑运算符赋值运算符其他运算符 算数运算符 下表显示了R语言支持的算术运算符。操作符对向量的每个元素起作...

问题 进行基因家族共线性分析的时候,拟南芥的可以提取到蛋白序列,但是另外物种在提取蛋白的的时候,pep.fa文件是空的?最后一节课的解决CDS文件提取不成功的方法不适此问题

跟拟南芥一样,也是转录本第一个是在基因名后面加的.1,为什么提取不了蛋白序列呢 我看了一下蛋白序列文件的转录本ID都是后面加的.1, 跟拟南芥的差不多啊,为啥提取不出来呢

问题 docker启动不了,指令输进去也运行不了

文章 指纹图谱绘制

...后AI打开导出的pdf文件,去除图的文字,操作如下。 Ctrl+A选所有,对象 选择 剪切蒙版 ,点击 释放。 选行名和列名,复制一份到新的文件。 然后在 选择 ->对象 选择 文本对象,然后删除所有文本。 删除...

文章 Excel的几个小技巧

Excel已经成为大家工作学习不可缺少的一款办公软件,在使excel的过程,如果掌握一些实的小技巧,就可以让你的工作效率有质的提升。 今天,小编给大家带来几个excel常的小技巧(以下所有操作均以excel2010为例),...

文章 把正在运行的任务提交后台

...把正在运行的任务提交到后台运行: 1.首先把任务暂停 ctrl+z 2.然后bg指令挂起 这时如果直接退出终端任务依然会停掉,所以 3.使disown命令将任务从终端的管理解除: disown %1#%1是指解除第一个任务的管理,想要直接释...

问题 老师,请教您一个关于通过序列号直接下ncbi上批量下载蛋白序列的问题,一般序列号都可以通过NCBI自带的Batch Entrez网站下载,但是我这个蛋白序列号不知为啥不能下载,下载结果失败图片在下面,麻烦老师帮忙。

原序列文件: Batch Entrez网站下载结果:

文章 compare_stat_boxplot.r metadata变量分组T检验比较并绘制box图

使说明: metadata按列分组,做差异比较分析,可以利 merge_tsv_files.r  或者  merge_metadata_genexpdata.r  将比较的信息合并到metadata: usage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_immu/scripts/compare_stat_boxplot.r       [-h] -m filepath -v variate [...

问题 eclipse 安装好了,也打开了,不过安装不了Perl和pydev.既不显示,也下载不了