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问题 第一次hmm搜索时可以搜索出序列,但是接下来一步提取结构域序列时出来的文件是空的

问题 请问第一次结构域搜索时检出了八条结构域1第二次结构域搜索需要每个结构域都提取吗

问题 蛋白三维结构预测swiss-model中搜索模型的时候,搜索到模版相似性最高的是算法得到,相对低的那个是试验证实的,应该选哪个构建模型

蛋白三维结构预测的时候,方法1利用swiss-model中搜索模板的时候,搜索到模版第一个相似性最高的往往是算法得到,而排在第二位的相对低的那个是试验证实的,那应该选哪个作为模板来建模呢?第二个往往是用PSI-blast搜索到同...

问题 老师好,我用hmm搜索斑马鱼TRP家族基因时发现搜索结果为空,但是斑马鱼是含有该家族基因的,请问这是怎么回事?

文章 分析基因家族时两种搜索基因家族成员方法比较

...定方法: 第一种、利用蛋白保守结构域的隐马尔科夫模型搜索。 第二种、利用BLAST序列比对搜索基因家族成员。 这两种情况的适用条件:如果要分析的基因家族有蛋白保守结构域的隐马尔科夫模型,就是用第一种方法,如果没...

问题 转录组中筛选功能基因是否需要分性别筛选

...在我毕业答辩的时候问我,为什么没有将雌雄转录组分开筛选功能基因。这个问题,也问住我了。我看绝大多数的文献都是直接从转录组中筛选自己想要的基因,很少有分雌雄的。希望老师能为我解答。

问题 老师,构建拟南芥特异性nbs基因家族hmm文件进行hmmsearch(e-20)搜索到的序列还需要到pfam或CDD进行再次搜索验证么,不进行这一步可不可以

老师,构建拟南芥特异性nbs基因家族hmm文件进行hmmsearch(e-20)搜索到的序列还需要到pfam或CDD进行再次搜索验证么,不进行这一步可不可以

问题 E-value值筛选

老师你好,我想请问一下我通过HMMER软件筛选了一批基因  但是我无法筛选他 E-value值筛选<0.0001的值怎么也筛选不了  请问有什么好办法进行解决?我想先筛选E-value值后在进行SMART分析结构域,万分期待您的答复。

文章 快速查找电脑中目标文件的方法

...一次遇到这个问题的时候,曾寄希望于Windows自带的文件搜索功能,就是下面这个东西: 但凡用过的小伙伴都知道,用这个东西速度太慢,简直等于慢性自杀,有时候半个小时也搜不完,一度让我怀疑笔记本里的i7 CPU是不是假...

问题 存在缺失分析

老师,我在做泛基因家族存在缺失分析时,得到的所有基因的存在缺失情况,为什么参考基因组(倒数第二行)中的基因只有几个,剩余基因均没有呢?

话题 文献搜索

话题 批量搜索

话题 domain搜索

话题 结构域搜索

问题 单细胞测序得出蛋白表达如何与GEO data发表的数据进行比对以验证数据的有效性