蛋白三维结构预测的时候,方法1利用swiss-model中搜索模板的时候,搜索到模版第一个相似性最高的往往是算法得到,而排在第二位的相对低的那个是试验证实的,那应该选哪个作为模板来建模呢?第二个往往是用PSI-blast搜索到同...
...定方法: 第一种、利用蛋白保守结构域的隐马尔科夫模型搜索。 第二种、利用BLAST序列比对搜索基因家族成员。 这两种情况的适用条件:如果要分析的基因家族有蛋白保守结构域的隐马尔科夫模型,就是用第一种方法,如果没...
...在我毕业答辩的时候问我,为什么没有将雌雄转录组分开筛选功能基因。这个问题,也问住我了。我看绝大多数的文献都是直接从转录组中筛选自己想要的基因,很少有分雌雄的。希望老师能为我解答。
老师,构建拟南芥特异性nbs基因家族hmm文件进行hmmsearch(e-20)搜索到的序列还需要到pfam或CDD进行再次搜索验证么,不进行这一步可不可以
老师你好,我想请问一下我通过HMMER软件筛选了一批基因 但是我无法筛选他 E-value值筛选<0.0001的值怎么也筛选不了 请问有什么好办法进行解决?我想先筛选E-value值后在进行SMART分析结构域,万分期待您的答复。
...一次遇到这个问题的时候,曾寄希望于Windows自带的文件搜索功能,就是下面这个东西: 但凡用过的小伙伴都知道,用这个东西速度太慢,简直等于慢性自杀,有时候半个小时也搜不完,一度让我怀疑笔记本里的i7 CPU是不是假...
老师,我在做泛基因家族存在缺失分析时,得到的所有基因的存在缺失情况,为什么参考基因组(倒数第二行)中的基因只有几个,剩余基因均没有呢?