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问题 转录组比对中,同源性很高的两个基因比对正确

在做转录组分析的时候,A和B基因相似性很高,外显子上面只相差几个碱基,差异很小,内含子差异大一些,在做转录组表达定量的时候发现,将A基因的count值全部归到B基因上。A和B是复制基因,序列同源性很高,在RNA-seq分析时...

文章 如何高效的管理技术开发团队

...⽀持将持续集成的结果部署到对应的测试环境,所有部署版本在测试环境中可随时访问,⽀持灰度发布到⽣产环境中。   3、成本   对于IT项目来说,最主要的还是人工成本的控制,一个好的项目规划,必定要在项目确定之前...

文章 苹果电脑 virtualbox共享目录权限问题

...方案”了--mac上开发,虚拟机上编译 :) 用virtualbox的mac版本装了个ubuntu, 安装go语言编译环境,一切顺利。 在把编译过的程序拷到共享文件夹时报permission denied错误。 ls -lah 发现host (我把共享目录mount到这个文件夹了) 的权...

问题 泛基因家族分析

老师您好,公司帮我整理的last.gene.pair文件中pangenID为啥用品系的缩写命名呢,没有规律性。这个影响后续的分析吗?

文章 iTOL修改进化树的标签基因ID名称

...下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)...

文章 单细胞转录组测序简介

...在单个细胞水平上对基因组、转录组、蛋白质组进行测序分析的技术。传统的转录组测序是对多细胞组织进行的混合测序分析,得到的是一群细胞内的基因表达的均值,由于单个细胞之间存在异质性,这样的数据丢失了细胞与细...

问题 转录组分析流程详细流程?

想问一下这个审稿意见是什么意思?是转录组分析过程哪一部分完整吗?下图是意见和我的转录组分析步骤。

问题 请问老师,motif分析之后,html文件打开,显示如下

not well-formed (invalid token) at line 177, column 44, byte 5589 at /biosoft/miniconda/envs/genefamilyenv/lib/meme-5.1.0/perl/CheckingSAX.pm line 46.Warning: meme_xml_to_html exited abnormally and may have failed to create HTML output.

问题 go term 一样为什么go功能一样

就是go的注释号一样而注释功能是一样的,这是什么原因,GSEA分析能有重复的注释功能,应该怎么办

文章 区分cds utr.exon

...要起于ATG止于终止子,都可以叫做ORF。ORF是一种预测,而是一种已知的翻译区 CDS: Coding DNA Sequence,是指mRNA序列中编码蛋白质的那部分序列。属于ORF(open reading frame),既然编码蛋白,那肯定以ATG开始--终止密码子结束。 CDS...

文章 基因组Hic挂AGP文件格式说明

...的是W、N和U。W表示WGS contig;N表示指定大小的gap;U表示明确长度的gap,一般用100bp长度。 6. 小片段的ID或gap长度(component_id or gap_length)     如果第5为N或U,则此列为小片段的ID。     如果第5列是N或U,则此列为gap的长度...

文章 从NCBI当中SRA数据库中下高通量测序数据

...用这些数据重新做数据挖掘,发表新的文章。 官方下方法太稳 要利用数据,首先得下得到数据,虽然SRA数据库提供的SRA Toolkit 工具包里的prefetch可以下,但是用这个方法下数据需要经过复杂的设置,而且经常莫名...

文章 ggplot2主题theme参数

...程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学...

问题 保守结构域

在NCBI上检测蛋白的保守结构域,怎么看它是是完整啊,小白在线求助

问题 网易云课堂WGCNA-加权基因共表达网络分析问题

学习过程中报错,用老师的代码和数据,前面出图和老师的一样,卡在这步 sft = pickSoftThreshold(datExpr0, powerVector = powers, verbose = 5) pickSoftThreshold: will use block size 2938.  pickSoftThreshold: calculating connectivity for given powers...    ..working o...