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文章 基因功能注释数据库DAVID 版本的更新情况

DAVID 是一款比较方便使用的基因功能在线注释网站,能进行一些基因ID的转换,还能够进行GO,KEGG的功能注释和富集分析。 十年前,基因功能注释的软件非常的少,DAVID 非常的流行,为广大科研人员所喜爱。但DAVID却在大家的溺...

文章 canda 安装的jcvi 遇到字体错误: UserWarning: findfont: Font family [u'sans-serif'] not found. Falling back to DejaVu Sans (prop.get_family(), self.defaultFamily[fontext]))

...基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提...

文章 proteusTMT 分析蛋白质组数据时,meta文件的格式是怎么样的?

蛋白质组数据,采用Maxquant 进行蛋白的鉴定和定量之后,可以采用R包“proteusTMT” 进行差异表达分析和统计分析。 其中比较关键的是如何在meta文件中设置样本标记信息和分组信息。 meta文件,格式(采用tab 分割)如下: measur...

问题 有参转录组测序分析,各个样品的数据与参考基因组的比对效率多高才能够满足后续分析?

问题 请教一下转录组测序中基因组大小为964M 测序数据量每个样本6G 测序深度大概是多少?

问题 基于转录组做了基因家族分析,结果基因组出来了,数据未公布,这个还可以再用吗?

问题 你好,家族分析时要求把序列和进化树上传到tree base数据库中,有上传过的吗?

问题 老师您好,使用beagle 进行基因型填充的时候填充依据是什么啊,是后台有参考数据库吗?

文章 excel快速求和

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 比如已知某条长链lncRNA PVT1,怎样用TCGA数据库查找它在肺癌癌和癌旁的差异?

比如已知某条长链lncRNA PVT1,怎样用TCGA数据库查找它在肺癌癌和癌旁的差异?应该学习组学大课堂哪一个课程?

问题 老师你好请问在跑WGCNA数据时遇到了这样的情况该如何解决呢,我有转门去加过内存还是出现同样的报错。

老师你好请问在跑WGCNA数据时遇到了这样的情况该如何解决呢,我有转门去加过内存还是出现这样的报错

文章 2018年测序相关国自然基金最全统计

...第一步,接下来要做的就是做实验、搞分析、发文章。在数据分析方面,我们组学大讲堂已为近6500人提供了专业、易学的0基础生信视频,涉及到R语言、转录组、微生物、基因家族分析、WGCNA分析、TCGA及GEO数据库挖掘等等方面,...

文章 UpSetR包绘制多维的venn图

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 string数据库下载的文件

string数据库下载的文件表头比较复杂,我给大家写一份说明书 1,neighborhood_on_chromosome: 这个特征表示在基因组中,两个基因是否靠近彼此,通常使用染色体上的物理距离来确定。如果两个基因在某些物种中距离非常接近,那么...

问题 R语言下载GSE数据一直在报错

> gset <- getGEO('GSE95394', destdir=".", + AnnotGPL = T, ## 注释文件 + getGPL = T) ## 平台文件 Found 1 file(s) GSE95394_series_matrix.txt.gz Failed to open file C:\Program Files\R\GSE95394_series_matrix.txt.gz.curltmp.File stored at: ./GSE95394_se...