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问题 基因家族分析-数据准备

输入agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff  $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_coding.gff3 以及agat_sp_keep_longest_isoform.pl --gff $species.protein_coding.gff3 -o $species.longest_isoform.gff3 这两个命令后总是报错bash: agat_sp_ke...

问题 想问一下视频课程里的data内容换成自己的数据就行了嘛？

问题 STRING数据库映射出来的拟南芥基因号不是AT开头的

问题 请问我在做性状绘图时出现报错，我的数据格式应如何修改

问题 单细胞测序数据两个子集合并

我想把CD4.added.celltype.rds文件和subsetCD8.reanalysis.rds文件进行合并，但是这两个文件的最后一列列名不同无法进行合并，有什么办法可以修改列名或者删除这一列呢？ CD4.added.celltype.rds对应的meta文件：CD4.added.celltype.metadata.tsv subsetC...

文章 组建专属KEGG数据库

前情提要： GWAS关联到的基因做KEGG富集，竟然全，不显著。所以听人劝，试试自己做一个自己物种的。 正文： step1： https://www.genome.jp/kaas-bin/kaas_main  KEGG注释的网址 step2：模仿下图填空  ps 上传文件有点慢呀  （找个不断网...

问题 您好，我使用rescript结合您发表的qiime2分类器建立sliva数据库一文，发现自己做到最后一步，数据库训练时一直显示内存不够，除了增加内存，还有没有其他的办法解决这个问题？例如，设置那些参数之类的？或者，我还要多大的内存才能做呢？谢谢

问题 您好，在NR数据库本地化的教程中，在运行perl脚本之后，内容为 unknown gi

您好，在NR数据库本地化的教程中，在运行perl脚本之后，内容为   unknown gi    请问有什么解决办法吗

问题 老师您好，请我一下您这里或是哪里有关于WGCNA分析的性状数据准备的详细介绍的资料或课程吗？因为我之前买了您这里的关于WGCNA分析的课程，但是课程里面用到的性状数据应该属于类别性状，用了01转换的，那要是数量性状应该具体是如何准备的我也不太理解，我看有人提到说是表达量，我也不太理解这个表达量指什么？请问老师有相关课程或资料吗？您这里有篇文章是讲了这两种性状数据，但是描述的有点简单。

文章 在线绘制circos的数据格式说明

...绍一下输入文件的格式。 1.您上传的文件必须是纯文本数据。该文件可以是空格或制表符分隔的。行名不可重复。列名亦是如此，行列名可相同。每一行必须有相同数量的字段。 任何#开头的行都被视为注释，而不是解析。空...

文章 NBT同时两篇文章：单细胞数据分析流程 比较

7种单细胞测序技术比较:https://www.nature.com/articles/s41587-020-0465-8 13种单细胞测序技术比较：https://www.nature.com/articles/s41587-020-0469-4

文章 Graphpad Prism绘制折线图

...常见的一类图，它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据，因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值。 Graphpad 绘制折线图方法： 1、打开Graphpad prism软件，选择XY图（XY graphs），点击折线图图标，并把样本数设为3，同...

文章 基因家族分析后续试验怎么做？

...个基因外均有保守的motif 1 和 motif 2（Supplementary Figure S1 数据未能找到）；TCP家族基因保守结构域包含Basic、Helix I、 Loop和Helix II 4个motif，并且class I (PCF) 与class II（CIN and CYC/TB1）相比，存在一个4个氨基酸的缺失，如下图： 4. TCP...

文章 R语言绘图-绘制漂亮的数学公式或者拉丁字母等在图当中

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...