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文章 细胞通讯cellchat结果介绍

单细胞实验设计让我们可以更迅速且准确的掌握每细胞涵盖的讯息,把实验做好做满之外,如何解读实验设计并完整阐述一故事,又是后期分析的另一项大考验。近期有不少 paper 提到 Cell-Cell communication (Ligand-Receptor),透过 L...

问题 没有转录组数据能进行基因家族分析吗?

...CBI上的数据,只需研究性状及实验设计符合即可,只需跑流程分析一下就可以了。

问题 多序列比对建树及保守结构域分析

老师好,我有问题,不同物种之间同源蛋白序列进行多序列比对时,是用保守结构域进行比对比较好,还是用全部序列比较好?因为很多序列是从NCBI上下的,不能保证其序列的完整性。而且出来的比对图非常长,不好往文章...

文章 低成本转录组跨种遗传进化分析

...无常环境下有极强的适应性;金蕨属(Acrostichum)包含三种:A. danaeifolium Langsd. & Fisch., A. aureum L. and A. speciosum Willd2 。这三种蕨类又具有不同环境的适应性,且金蕨属是唯一生长在潮汐带上的蕨类,在蕨类植物中占用特殊的...

文章 基因编辑RAW264.7细胞系—助力炎症以及破骨细胞生成相关研究-源井生物

...团库。研究者在体外和体内都筛选了家族,并选择了一更好的家族来将mCas9/gNLRP3导入巨噬细胞中,通过破坏巨噬细胞中的NLRP3来改善脓毒症休克,mCas9/gNLRP3诱导的腹膜炎和HFDinduced T2D。研究为CRISPR/Cas9进入巨噬细胞和治疗多种...

问题 老师您好,跟着讲解计算转录组power时,提示文件太大,怎么办

有154111基因

文章 docker 镜像 中plink 出现报错 segmentation fault

解决办法:1.加大docker的内存:https://www.omicsclass.com/article/1413  2.可能由于编译plink软件的系统和运行软件的系统不同,也就是内核不同可能导致segmentation fault,  这种原因是系统原因的问题只能换电脑试试;

文章 中小企业团队敏捷产品开发流程的最佳实践

...是检视、调整和同步每日工作计划,帮助团队把工作做得更好。 03执行 进行Scrum敏捷软件开发,团队成员需要熟练一些应用软件开发技术实践,比如持续集成、自动化测试、重构、测试驱动开发等,这些技术实践会给开发团...

问题 请问怎么从镜像里拷贝pl脚本

agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl agat_sp_keep_longest_isoform.pl 课题组服务器不让安docker,请问怎么怎么从omicsclass_gene-family镜像里下载这脚本呢我下载镜像文件到本地,解压后是一堆随机码命名的文件

问题 请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量

我有几不同浓度胁迫下的转录组数据,想利用此数据分析一下某基因家族,请问如何结合转录组数据分析某基因家族的表达量?

文章 IF=13.8 | 饮食调节山羊肠道微生物的纤维素利用效率

...oats ”的宏基因组分析文章。” 01 — 研究背景 整生物界的生物资源是有限的, 反刍动物(如羊)能够利用人类无法利用的生物质,如植物细胞壁纤维转化为高质量的动物产品,因此,了解消化道中影响纤维素降解效率的微生...

文章 BiocManager::install("seqinr")时报错

make: *** [surfaceArea.o] Error 1 ERROR: compilation failed for package ‘sp’ * removing ‘/share/work/biosoft/R/R-v4.2.2/lib64/R/library/sp’ * installing *source* package ‘Rcpp’ ... ** package ‘Rcpp’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** using staged installation ** libs g++ -...

文章 rainbow函数取色

..., end = max(1, n - 1)/n, alpha = 1) 例如,基于彩虹色渐变获取10颜色,依次由red、yellow、green、cyan、green、blue 、magenta等顺序细化而成: > rainbow(10) [1] "#FF0000FF" "#FF9900FF" "#CCFF00FF" "#33FF00FF" "#00FF66FF" "#00FFFFFF" "#0066FFFF" [8] "#3300F...

文章 2019最新影响因子出炉:生物类期刊有哪些变化?

...了最新影响因子(Impact Factor,IF)。 这份JCR报告涵盖了236学科,且今年的JCR报告中新增了283种期刊。 不过,还有少部分期刊的影响因子尚未发布。 下面,学霸姐姐来简单的总结解读一下大家可能比较关心的期刊。 排名第一...

文章 产品/项目经理,有效提高效率的11种方法

...能力。与能力匹配的就是拥有不同的思维方式。 许多微不足道的反射神经所产生的思想,最终导向到某结果或决策。如果能够明确,很显然是可以事半功倍,走向成功的。 当你真正具备了这些思维,面对下一五年甚...