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问题 数据集对应可重建的进化树

您好! 最近遇到了一跨领域问题,百思不得其解。有一数据集它包含30基因序列,我用mega软件即使每次选择不同的建树方式也只能得到四棵不同进化树,但我在GitHub上看到一项目MO-Phylogenetics,它里面的一基因序列数...

文章 天天加班,为什么团队研发效能还是那么低?

...者弄清项目的剩余时间,评估工作进度,调整工作任务,更好地把握项目的整体。 2.2 站立会、周会 每日站立会以及周会是保证项目正常进行的手段之一,通过每天的站立会沟通,确认团队成员是否遇到了问题,针对问题进...

文章 科研汪:你知道自己是什么“实验垃圾”吗?

...为, 在“实验垃圾”面前, “生活垃圾”分类,还是小!学!生! 生活垃圾才分了4类:干垃圾、湿垃圾、有害垃圾、可回收垃圾, 实验室垃圾分类何止4类,简直小巫见大巫! 而且,各种各样的实验室垃圾不仅要一样一...

文章 Linux的shuf命令对文件的行进行随机排序

Linux常用命令shuf用于把输入行按随机顺序输出到标准输出。 具体用法如下: shuf命令会将final.bed文件中的所有行随机排序,-n选项设置显示前1000行。 常用参数有: 示例: 生成3范围为1-100的随机数到文件rand.txt中

问题 tcga_gene_exp_download.r -p TCGA-STAD -m 下载tcga数据,过程中进程多次在同一地方被killed

问题 测序公司给我的结题报告和结果文件里面分别是什么呢?

我在一家公司测了转录组,公司给了我一份结题报告和结果文件,这两东西有什么区别吗?我应该以哪为准呢?

文章 IF=8.78|非肿瘤数据挖掘思路(GWAS Catalog

...(conditional false discovery rate  cFDR),该方法的思想是与两相关性状都相关的变异位点更有可能是真实的变异位点,因此,在整合多研究时更有可能被鉴定到。该方法是经验贝叶斯错误发现率方法的延伸,应用到两表型的情...

文章 R语言sort()与order()

... 例如基于向量A操作(A也可以是数值型): > A=c("A","B","D","C","H","J","E") 1、sort sort(x, decreasing = FALSE, ...) 默认升序 > newA1=sort(A)> newA1[1] "A" "B" "C" "D" "E" "H" "J" 降序:设置decreasing=T > newA2=sort(A,decreasing = T)&gt...

问题 利用人类基因组进行群体遗传PSMC分析求助

...因组进行PSMC分析,我的bam文件是按照染色体分的,一共22常染色体22bam文件,那么他们如何作为输入文件写进代码里面呢?我看代码输入文件是一bam文件,我是需要把bam文件进行 samtools merge吗?

问题 基于全基因组信息进行AAI和ANI分析

老师们好。我想做一下基于基因组来计算DNA-DNA hybridization (DDH), Average Nucleotide Identity (ANI), Average Amino Acid Identity (AAI)分析,但是要使用的俩软件(Jspecies和CompareM)不太会弄,有没有哪位老师做过,谢谢!Q:1870871361

问题 如何找到差异基因的整体通路以及实现可视化?

...差异基因里,通过功能注释可以找到这图中通路的上某几基因,想知道要怎么像他一样把通路整体找到然后画出来?是要自己把每相关的基因搜出来,然后到KEGG上找吗?还是可以批量进行?搜的时候是要输进什么去搜?

问题 你好,想求助一下关于在CGView中进行COG分类的文件问题

您好,我看有帖子下有您关于CGView COG文件注释的问题,正好我也在弄这,想请问一下具体是怎么操作的呢,希望您能回答一下,谢谢

文章 女生考研真的好吗?——导师不爱、工作歧视......

...女生终于成为了考研群体的主流。你以为成为主流就会有更好的福利和待遇吗?其实并没有。女研究生现状:导师不爱,工作被歧视目前国内搞科研的女生人数越来越多,甚至有阴盛阳衰之势:某知名985大学某专业复试12取5,参...

文章 挖掘公共基因大数据的时代已经到来

经过NGS十余载的商业运营,要想找生物实验室完全没听说过测序的也是很难了,为了各种实验目的,自己去测点数据已经是稀松平常的事情了。但是马上要到来的公共数据挖掘时代,您是否有足够的认识? 如果您还没有感知...

文章 topGO报错

...opgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes(),其中提供的第二参数不能有0,否则会报错: showSigOfNodes(sampleGOdata, score(resultKS.elim), firstSigNodes = 10, useInfo = "all") Error in if ((n <- as.integer(n[1L])) &gt; 0) { :           missing value where TRU...