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问题 16s分析导入数据遇到同样的问题，请问您解决了吗?

There was a problem importing /work/omicsclass/ampliseq-q2/qiime2_2022.8/data_2/manifest.ckd.txt:   /work/omicsclass/ampliseq-q2/qiime2_2022.8/data_2/manifest.ckd.txt is not a(n) PairedEndFastqManifestPhred33V2 file:   Filepath on line 3 and column "forward-absolute-filepath" could not be fo...

问题 16S Picrust2

...───────────────────── tidyverse 2.0.0 ── ✔ dplyr     1.1.3     ✔ purrr     1.0.2 ✔ forcats   1.0.0     ✔ stringr   1.5.0 ✔ ggplot2   3.4.4     ✔ tidyr     1.3.0 ✔ lubridate 1.9.3 ── Conflicts ───...

文章 Docker Volume - 目录挂载以及文件共享

...似在系统中使用 mount 挂载一个文件系统。Docker文件系统工作情况想要了解Docker Volume，首先我们需要知道Docker的文件系统是如何工作的。Docker镜像是由多个文件系统（只读层）叠加而成。当我们启动一个容器的时候，Docker会加载...

问题 有参转录组分析，合并样本count值文件报错。

...t.py -p all_gene_count -f normal_rep1_gene.tsv -l normal_rep1 -f normal_rep2_gene.tsv -l normal_rep2 -f normal_rep3_gene.tsv -l normal_rep3 -f tumor_rep1_gene.tsv -l tumor_rep1 -f tumor_rep2_gene.tsv -l tumor_rep2 -f tumor_rep3_gene.tsv -l tumor_rep3 Traceback (most recent call last):   File "/mn...

文章 openssl 安装

...载自己想要的版本的OpenSSl https://www.openssl.org/source/old/1.0.2/openssl-1.0.2u.tar.gz 代码语言：javascript复制#解压 tar -zxvf openssl-1.0.2u.tar.gz 代码语言：javascript复制#进入目录 cd openssl-1.0.2u/ 代码语言：javascript复制#编译安装 ./config --prefix=/...

文章 世界500强常用的管理方法和工具推荐

...具可以帮助我们规范化一体化，工具还可以帮助我们提升工作效率，专业管理人员必须要会使用工具。 下面给大家介绍九种高效率的处理工作的管理方法与管理工具，通过学习这些方法让你的工作变得有条不紊，可进可退，...

文章 利用 NAS 对实验室数据进行存储备份

...乱。导师担心前人走后，新人没有办法很好地接受前人的工作（比如说需要摸索一段时间在自己电脑上配置软件，或者可能没有师兄的前期实验数据很难开展后续的工作等等）。因此，导师买了台群晖NAS专门用于数据存储。接下...

文章 awk批量输出不同分类内容至不同文件

...同类别，基于这些分类将数据拆分  写入不同文件。 Sme2.5_00225.1_g00009.1 5       4.9101421148427 4.70706424227   4.47761327337Sme2.5_00013.1_g00022.1 2       21.1187 23.221  29.6611Sme2.5_12110.1_g00002.1 1       1.433897        1.54817336...

问题 基因家族提取用hmmsearch --domtblout result.txt --cut_tc zf-C2H2.hmm Fvesca_226_v1.1.protein.fa 时提示 Failed to open tabular per-dom output file result.txt for writing

我用Bio-Linux-8.0.7.2018.10.31可以运行这一步，但Bio-Linux-8.0.7-2019.3.20这个版本运行出现上的提示，请老师指导

问题 变异注释

...ant_function file (exonic format error): <line79synonymous SNVLOC119691921:XM_048633226.1#NC_063982.1#16995:exon3:c.C99T:p.L33L,LOC119691921:XM_048633233.1#NC_063982.1#16995:exon3:c.C99T:p.L33LNC_063982.11813318133CT0.43752219.779NC_063982.118133.CT2219.77PASSAC=7;AF=0.438;AN=16;BaseQRankSum=-2.6...

问题 perl 哈希输出的问题

...内容看不到，请问怎么才能只看每次运行的报错内容。 2.之前已经提取了需要的数据放入了“%motifID”，部分结构如下：           'sequence_117' => {                              'name' => 'Gohir.A01G185500.1_and_Go...

问题 利用perl脚本提取基因上游的1500bp（指定位置）序列时提示出现Incorrect parameters to subseq的错误

... -format => 'Fasta');$out = Bio::SeqIO -> new(-file => ">$ARGV[2]",                                  -format => 'Fasta');my %keep=() ;open IN,"$ARGV[0]" or die "$!";my%ref=();while ( my $seq = $in->next_seq() ) {     my($id,$sequence,$desc)=($seq->id,$seq->...

问题 IBD计算

...py这个脚本， python3: can't open file '/work/script/cibd.py': [Errno 2] No such file or directory python3: can't open file '/work/script/cibd.py': [Errno 2] No such file or directory python3: can't open file '/work/script/cibd.py': [Errno 2] No such file or directory python3: can't open fil...

问题 用4d位点跑mcmctree报错Error: strange calibration?.

老师好，我的工作文件是 12.time_tree_4d日志文件报错显示： ——————————————————输入文件如下 序列文件： 标记两个分化节点的树文件： （树文件来源 ln -s ../03.Phylo_Tree/raxml.4d.raxml.support species.tre） （分...

文章 基因家族docker 镜像使用方法

...化树分析###########################################cd $workdir 回到工作路径mkdir gene_tree_analysiscd gene_tree_analysiscp ../WRKY_domain_confirmed.fa .cp ../WRKY_pep_confirmed.fa .cp ../WRKY_cds_confirmed.fa .cp ../WRKY_domain_new_out_removed_redundant.txt .#########################利用...