问题 请问导入数据时总是出现：“no such command”是什么原因啊

问题 有40个样本的基因型（重测序结果）、表型数据。可以做什么分析？

文章 NCBI数据库当中下载基因组序列，cds序列，蛋白质序列等

1.打开NCBI主页：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/   数据库选择gemome,输入物种拉丁名 Homo sapiens搜索: 搜索结果如下： 包括基因组的信息，gff信息，蛋白质信息等等都可以点击下载，如果基因组组装有多个版本可点击browse list，查看多...

文章 堆叠柱状图-ggplot2

绘制堆叠柱状图，重点重点在于geom_bar中postion="stack"， 数据参考：https://www.omicsclass.com/article/92 dat   type  Sample Num1     A sample1  902     B sample1  343     C sample1  564     D sample1  995     E sample1  156    ...

文章 TBtools绘制火山图

...有没有简单点的方法呢，其实TB tools也可以绘制。 准备数据如下： 打开TBtools 导入文件，点击Start 生成火山图如下： 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1. 文章越来越难发？是你没发...

问题 您好，在NR数据库本地化的教程中，请问 这两个文件是在哪里下载的呢

您好，在NR数据库本地化的教程中，请问<division.dmp> <nodes.dmp>这两个文件是在哪里下载的呢

文章 做微生物研究必懂的OTU table相关知识

...理视频帮助理解； https://v.qq.com/x/page/f0519pz5jmw.html 原始数据处理： 根据测序barcode序列区分不同的样本序列,将数据分开至不同的样品中。原始测序数据需要去除接头序列，并将双端测序序列通过序列之间的overlap拼接成单条序...

文章 人类癌症数据库突变注释

cosmic70: the latest COSMIC database with somatic mutations from cancer and the frequency of occurence in each subtype of cancer. For more updated cosmic, see instructions below on how to make them.icgc21: International Cancer Genome Consortium version 21 mutations.nci60: NCI-60 human tumor cell lin...

问题 在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的？？？

在pfam数据库中下载hmm文件的时候用到的那个序列号是哪里找的？？？ ncbi？ 中国知网？？ 如何搜索？？？

文章 NCBI 基因ID命名规则 Ensembl数据库ID命令规则

了解数据库NCBI中各种ID的命名规则可以迅速了解ID背后代表的是什么： NCBI中 前缀 意义 NM_/NP_ 已校正的mRNA/蛋白序列ID XM_/XP_ 软件预测的mRNA/蛋白序列ID NC_ 一般为染色体序列ID NG...

文章 lnd无法下载样本名称含有+的数据

linuxnd linuxnd是linux系统下载诺禾致源测序数据的软件，其基础功能如list、cp、cp -d 已经在这篇文章中给大家列出： https://www.omicsclass.com/article/2084 错误的产生 该软件在遇到样本名称中含有“+”的样本时，无法直接进行下载，...

问题 GPL7280的数据，可以读取进来，处理的过程中总是报错，请问这个cdf怎么样能解决？

GPL7280的数据，可以读取进来，处理的过程中总是报错，请问这个cdf怎么样能解决？

文章 分组柱状图--ggplot2

...gplot2绘制分组柱状图，并进行组内分隔。 加载R包、设置数据 library('ggplot2')library('reshape2')A = c("A","B","C","D","E")B = c(90,34,56,99,15)C = c(50,20,24,70,14)dat = data.frame(A,B,C)names(dat) = c("type","sample1","sample2")dat = melt(dat,variable.name="Sample",value.nam...

文章 群体进化和GWAS文章没那么难发！

... 03 为了进行准确的性状关联，作者统计了两季的性状数据（包括8个农艺性状），使用SUPER GWAS的方法进行性状关联，检测并统计分析MTAs（marker–trait associations）。 同时，作者对两季性状数据的关联结果进行了比较分析，并...

文章 2019年国自然结果即将公布，近5年各项数据解读

... 今年的立项情况会是怎么样的呢？ 学霸姐姐用历年的数据情况来大致预测一下。 从14年-18年数据来看，每年的申请项目数和批准资助的项目数都是逐年增加的，但由于两者增长不平衡，总体资助率呈逐年下降趋势。 此外，...