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问题 群体结构分析

请问老师,家系和野生的群体核酸多样性总pi值没有差异,但是LD衰减分析看是野生的衰减速度更快,这两个结果相符合唉?这是什么原因呢?应该是衰减速率快的种群可能拥有更高的核酸多样性吗?

文章 R语言中实现T检验及可视化

...1.5) 结果图如下: 推荐学习R语言获得更多生物信息分析技能:R语言画图、R语言快速入门与提高 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析...

文章 PBS 命令

...下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)...

问题 老师,在做共线性分析的时候,在gff文件中提取出来的基因位置信息和ID号,与蛋白质文件中的ID号一致,一个为基因号,一个貌似为转录本的号,所以提出来蛋白序列,这种情况应该怎么办呢?并且有些基因在哪条染色体上也没有研究清楚好像,所以提出来的有些基因的染色体号为0,那如果这样的话还可以往下做共线性分析

问题 基因家族分析:要是GFF文件中没有mRNA这一项的话,应该怎么处理加上这一行?我看有加gene这一行的,知道怎么加mRNA这一项

文章 16S扩增子测序后的PICRUSt预测功能分析原理

...封闭式”参考OTU划分,并将得到的OTU丰度矩阵上传至Galaxy在线分析平台(http://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/root?tool_id=PICRUSt_normalize),按提示操作就能得到预测结果。 4、16S+PICRUSt,研究新趋势 PICRUSt这一方法横空出世后,已有越...

问题 老师您好,我正在做泛基因家族分析中,家族成员存在缺失分析,需要准备泛基因组列表,前面通过学习咱们得泛基因集构建课程,生成了 final.last.gene.pair.txt 文件,整理格式之后正确

老师您好,我正在做泛基因家族分析中,家族成员存在缺失分析,需要准备泛基因组列表,前面通过学习咱们得泛基因集构建课程,生成了 final.last.gene.pair.txt 文件,我的文件为: 现在需要整理成需要的格式,参考教程awk -F"\t|-|...

文章 TCGA数据下—TCGAbiolinks包参数详解

...据挖掘生物信息文章(宫颈癌)GEO数据挖掘直肠KM-plotter在线做生存分析GEO数据如何挖掘?案例解析!免费领取生信课程(适合小白自学生信)《Linux生信分析环境搭建Bio-linux》细述ceRNA网络研究思路TCGA数据挖掘文章-分析ceRNA的“...

文章 天宫一号曾为农业做出的贡献!

...,会挖掘的数据,没有思路的文章,沟通畅的个性化分析,求人如求己,一切痛点都能解决: 1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做更牛的个性化分析,绘更漂亮的图,点这...

问题 老师,您好,昨天我跟着您的视在docker上做blast分析,但我知道怎么从第一个界面退回第二个界面,请问是需要按哪个按键?

文章 easySFS的使用

...将VCF文件转换成各种格式的SFS文件,可以用于其他软件的分析。 输入文件有两个,一个是VCF文件,另外一个是VCF文件中样本的分类文件。 sample1 pop1 sample2 pop1 sample3 pop2 sample4 pop2 他的使用一般有两步,第一步是运行preview,确...

文章 IF=5.7 | 转录组数据揭示类风湿关节炎的临床诊断模型

...ogram model and subtype classification in rheumatoid arthritis 的转录组分析文章 ” 文章借助单细胞转录组数据、芯片转录组数据以及eQTL遗传变异数据来筛选类风湿性关节炎中潜在的致病T细胞标志基因。 类风湿关节炎(RA)是一种常见的自身...

文章 linux解压打包命令大全 tar gzip rar 等等

...硬连接是否存在以及该文件是否为符号连接。 -h或--help 在线帮助。 -l或--list 列出压缩文件的相关信息。 -L或--license 显示版本与版权信息。 -n或--no-name 压缩文件时,保存原来的文件名称及时间戳记。 -N或--name 压缩文件时,...

问题 老师,我用hmmsearch 没搜索出结果,然后用拟南芥的query.fa和我要分析的物种cds进行blast分析,比对出来的基因只有几个,我老师说我要做的基因有200多个,完全对上,知道该怎么办了,请教下老师。

问题 微生物16s实操教程

OTU分析按照视中方法一(pick_de_novo_otus.py)做的,显示usearch版本对,应该怎么办?