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问题 请问,利用Linux制作circos配置文件时,result文件无数据是什么原因

配置circos作图文件时,result文件夹能正常生成,也没有报错,但是result文件中,genome.blocklink.txt文件为空,genome.blocklink.txt文件只有aliment但是无数据,检查基因序号对应无误,不知道问题出在哪里

文章 ANNOVAR琳琅满目的人类变异信息注释数据

...gene-based annotation) 人类基因组上的基因注释来源有三个数据库,可任选其一进行注释,从而可以知道变异与基因的关系: refGene   NCBI  RefSeq Gene knownGene  UCSC Known Gene ensGene  ENSEMBL Gene 二、基于区域的注释(region-based anno...

文章 批量搜索替换MySQL数据库中的内容

...对所有的student_name 进行搜索替换,如果需要限定特定的数据,后面可以加where限定,如下: UPDATE student SET student_name = replace(student_name, 'John', 'Mark') where id =11;

问题 "组学大讲堂"--Linus常用命令处理生物数据,这一课的免费视频在哪里?

我在购买的课程视频里得知,"组学大讲堂"--Linus常用命令处理生物数据,这一课是免费的。在网易云课堂上。可是我一直没有找到。求指点。谢谢

问题 RNA-SEQ有参转录组的课程,可以来分析全转录组数据

有参转录组课程的代码可以用来分析全转录组数据吗,lnRNA,miRNA这些也可以用hisat2注释吗

问题 多样性数据实操 OTU注释报错

老师 您帮我看看 我用了视频里的代码 但是报错 您讲这一块的时候 说时间太长 没有直接跑 我按源代码都报错

问题 请问重测序可以得到某物种的全基因组序列吗,能不能从重测序数据中找到某个基因的完整序列?

我这里有两株酵母的重测序数据(clean data),可以通过这两个数据得到这两株酵母的全基因组序列吗?另外,我想得到这两株酵母种某个基因的完整序列,可以实现吗?还是说重测序只能得到变异信息。

问题 荧光定量PCR数据与预期相反

在做一条通路中关键基因在不同诱导子诱导下的表达,已知在这些诱导子诱导下,通路最终产物含量均提高。需要基因表达量提高才能证明基因关键。但做出来表达量降低。原因可能是什么呢?求各位大神解答。(PS:如果真是基...

问题 一般动植物进行转录组测序,要测多少数据量,如何估测?

问题 在TCGA构建ceRNA网络,数据用代码下载不完全啊

问题 请问如果其他数据的metadata.tsv与barcode如何做出来?​

问题 测序数据合并后只有一个fastq文件如何export为全局变量

问题 我现在的数据格式,怎么进行GO和KEGG富集分析呢?

问题 SNP数据统计

老师,群体遗传中使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l查看不同样品共获得多少SNP,那如何查看每个样品各自拥有多少SNP呢?在该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP,但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP...

问题 SNP数据统计

老师,群体遗传中使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l查看不同样品共获得多少SNP,那如何查看每个样品各自拥有多少SNP呢?在该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP,但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP...