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问题 老师你好, 一般来说,hmmer搜索出来的结果和 blast出来的结果,哪个比较好一点呀?

问题 请问GEO芯片数据挖掘课程只适于芯片数据,还是geo上转录组测序数据都可以

问题 docker分析不同物种间共线性分析图片染色体图片出现缺失,这个该怎么修改

问题 这里的hmmer分析的是两个结构,也就是两个pfam号,那要怎么分析两个呢

问题 docker desk设置文件共享夹不能同步

老师,您好! 我输入 docker run --rm -it -v /Users/ethan/Desktop/biolinux:/work omicsclass/biolinux:latest命令想创建一个共享文件夹,但是我在输入ll查询文件后,发现红框里显示的东西在我电脑的文件夹里并没有。而且我在电脑文件创建一个测...

问题 比如已知某条长链lncRNA PVT1,怎样TCGA数据库查找它在肺癌癌和癌旁的差异?

比如已知某条长链lncRNA PVT1,怎样TCGA数据库查找它在肺癌癌和癌旁的差异?应该学习组学大课堂哪一个课程?

文章 qRT-PCR相对定量计算详解 qPCR

...PCR原理: 以基因的cDNA为模板进行PCR扩增,在PCR扩增过程,通过收集荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct 值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以可以定量。 Ct值是什么意思呢? Ct 值...

问题 deseq_analysis.r分析差异表达分析时报如下的错误

[1] "abstract_factors is start" Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec,  :   line 2 did not have 3 elements Calls: abstract_factors -> read.table -> scan Execution halted

问题 我想两个基因组去比对我的转录组,但公司告知我这两个基因组都没有功能注释信息。

老师:        您好!  我想两个基因组去比对我的转录组,但公司告知我这两个基因组都没有功能注释信息。 下图是两个基因组gff  gff3文件的截图,我就搞不懂,这里面都有些啥?转录组比对时,所需要的是啥?

问题 老师您好,我想真菌线粒体基因组做群体遗传分析,已经组装好线粒体基因组,是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利reads筛选snp么?

问题 老师您好,我想真菌线粒体基因组做群体遗传分析,已经组装好线粒体基因组,是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利reads筛选snp么?

问题 ncbi搜索pfam号 为什么没有 出来的是pmid 怎么办 文章也没有pfam号

问题 请问怎么RNAseq获得的counts数据,再计算相应的FPRM值呢?求较详细方法或建议。谢谢了

问题 计算每一个单因素cox分析时,lapply函数,好久都没有反应,怎么解?大概有20个小时了。

问题 请问一下,就做了一个转录组测序,样本是不同的组织,能否WGCNA分析分析,写个文章?

这里的组织相当于指的是根茎叶花,花瓣,纤维,胚珠等22个组织,没有其他处理。