1. 安装 前提：Linux系统中已安装有Python环境； 安装bypy库和requests库，安装方法如下： pip install requests -i https://pypi.doubanio.com/simple pip install bypy -i https://pypi.doubanio.com/simple 2. 授权 首先把数据上传到百度网盘，...
...gt; 123root@c55671066dec:/js# ls123root@c55671066dec:/js# exitexit语法差不了多少，也是 -v 来指定，不过这时候“:”前面已经不是宿主机的目录了，而是换成 js-data 这个数据卷了，当然这个目录是空的。然后我们给他添加了一个新的文件 123，...
...，exit 不中断容器运行 当进入容器完成相关操作，使用 [ctrl+d] 或 exit 命令退出容器后，使用 docker ps 查看发现容器已经退出,如何避免这种情况呢？一、环境说明Docker：17.09.1-ceDocker Image: CentOS 7二、问题重现1. 创建并运行容器➜ d...
微生物多样性分析中最基础、最重要的文件为OTU table，几乎所有的后续分析，如alpha多样性分析，beta多样性分析，差异分析等等都是基于OTU table展开的。因此理解OTU table的含义和来路，对微生物多样性分析至关重要。下面我们就...
...efault 二、挂载数据到虚拟机： 1. 先设置 到 VirtualBox 中 docker 用的那个虚拟机的共享文件夹 填写好共享文件夹路径和名称。如：共享文件夹路径：d:\ 共享文件夹名称: d 然后勾选自动挂载和固定分配2.重启之后就有/d ...
... "-rich" contig.full_mask.gff >contig.full_mask.complex.gff#对基因组中的重复区域屏蔽 bedtools maskfasta -fi ../contig.fa -bed contig.full_mask.complex.gff -fo contig.hardmasked.fabedtools maskfasta -soft -fi ../contig.fa -bed contig.full_mask.complex.gff -fo contig.softmasked.fa
...内容-r：向压缩归档文件末尾追加文件-u：更新原压缩包中的文件这五个是独立的命令，压缩解压都要用到其中一个，可以和别的命令连用但只能用其中一个。下面的参数是根据需要在压缩或解压档案时可选的。-z：有gzip属性的-j...
...在上课做26个玉米基因组的基因家族成员鉴定等分析时，用的是docker run -it -m 3G -v/home/us132/pan-gene-family:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v1.0镜像，而做泛基因集列表时用的是docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/...
...一步挖掘。 数据和样本都是已经存在的，假如你有好的idea，那就快行动起来吧！挑战人类认知；冲破现有知识桎梏束缚；推动人类文明进步的重任非你莫属了！ 假如你目前还不擅长利用大数据来进行科学研究，没关系！现在...
...一步时遇到一个问题，我已经验证过每个基因在CDD数据库中都有WRKY结构域和锌指结构，但是后面做到蛋白质全长多序列比对分析用GeneDoc查看结构域时发现有些基因结构域不全，好多基因都没有锌指结构显示，我怀疑是 #截取得...