问题 GEO芯片数据挖掘课程中PCA分析

老师您好，请问图中的问题如何解决啊

文章 qRT-PCR相对定量计算详解 qPCR

...表达定量的方法，他的计算方法有很多，常用的相对定量数据分析方法有双标曲线法，ΔCt法，2^-ΔΔCt法(Livak法)，用参照基因的ΔCt法和Pfaffl法。这里主要讲解常用的2^-ΔΔCt法(Livak法)如何计算； qRT-PCR原理： 以基因的cDNA为模板...

文章 蛋白质组与转录组的关联分析如何做？

...找某些关键的代谢通路或者调控因子； 3、对于一些蛋白数据库不完整的物种，通过转录组数据构建蛋白质库，可以大幅度提高蛋白质的鉴定数。 然后，材料选取上需要注意什么？ 根据研不同的究目的，选取不同处理的样本...

问题 TCGA数据中如何区分样本是癌症还是癌旁？

问题 如何利用自己的差异基因数据绘制kegg注释图

问题 测序的数据txt格式如何转换成fasta格式

问题 gemma分析时，有的样本表型数据缺失怎么办？

问题 在ncbi找不到制作热图的数据，怎么办

问题 iGRN数据库如何找到上下游调控基因

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文章 BLAST+使用方法

....nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 使用方法如下： 格式化数据库makeblastdb -in db.fasta -dbtype prot -parse_seqids -out dbname参数说明:-in：待格式化的序列文件-dbtype：数据库类型，prot或nucl-out：数据库名 蛋白序列比对蛋白数据库（blastp）...

文章 生存分析的一些基本概念

...下。 生存分析(Survival analysis)是指根据试验或调查得到的数据对生物或人的生存时间进行分析和推断，研究生存时间和结局与众多影响因素间关系及其程度大小的方法，也称生存率分析或存活率分析。起始事件(initial event)：反应...

文章 在R里绘制地图

在R语言中绘制地图是数据可视化的一个重要方面，其提供了多种方法和工具包来绘制地图，包括基于经纬度数据的地图、行政区划图等。今天教大家使用ggmap、maps这两个包，进行地图的绘制。 ggmap 1 代码 ggmap包能够从多种在...

文章 Split划分数据

利用split可以对数据进行分组 split(x, f, drop = FALSE, ...) x 表示一个待分组的向量或者数据框 f 表示一个factor或者list，以此为规则将x分组 drop 是逻辑值，如果f中的某一个level没有用上则被弃用 例如有如下数据： dat Samples g...

文章 TCGA生存分析课程的数据准备

请问，在TCGA差异分析课程中的差异表达矩阵是用ensembleID表示lncrna，而TCGA生存分析的表达矩阵是用lncrna的gene symbol，请问是怎么转换的，用ensemble官网转换之后，代码总报错，请问该怎么解决呢，谢谢