文章 一文教你转录组数据如何挖、文章怎么写！

...差异表达的基因集，结合麦穗发育的机制，挑选生长素和细胞分裂素相关的基因，研究其表达模式，并用q-PCR验证。 4. 转录因子在植物的生长发育过程中起到关键的作用，作者分析了不同家族的转录因子在穗发育过程中的表达...

文章 网站 SSL证书到期更新

...易名中国验证   （3）证书配置：视频点播服务=》配置管理=》分发加速配置=》域名管理  class.omicsclass.com 2.网站SSL证书到期：www.omicsclass.com （1）先申请免费的SSL：选择手动DNS验证 ：https://yundun.console.aliyun.com/?spm=5176.12818093.to...

问题 老师，使用perl脚本提取序列，系统重新提示命令格式？

文章 保姆式教程！手把手教你使用Simplot，绘制高大上的序列相似性图片

...显著差异，大部分区域的相似性均低于95%。 下载Simplot,打开Simplot，file——open——SeqPage—— Use first characher to identify groups——Use characherprior to occurrence of Separator to  groups,可将1改为2或3或4，5.......这个是为了显示名称的前几...

问题 lncRNA预测的软件有那些？

转录组分析中，针对新的转录本进行长链非编码RNA的预测，有什么软件可以预测？

文章 多种进化树编辑处理软件

进行系统进化树编辑的软件很多，可以根据相关的网页进行下载，譬如： 1、http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/software.html#Plotting  其中就涉及我常用的MEGA和FigTree等 注：原网站 http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/software.html ...

问题 mega上拖进fasts格式文件时显示文件解析错误

问题 WGCNA输出的cytoscape的文件出现格式错误

...ID聚集在一个文件里：多个小文件表现为这样，连通性等格式正确，但是没有基因ID（全显示为NA）： 文件仍是以模块颜色来分的，且都是edges的文件。 代码用的是课程里下载的无性状代码： 十分感谢老师百忙之中的帮助！ ...

问题 WGCNA 模块特征热图意义

各位老师，我用WGCNA分析的芯片是有9个细胞系每个细胞系加两种处理因素，但是没有重复这种。当然也没有可关联的临床特征。如图，我这个绿色模块，根据模块向量特征热图，H处理之后，它的模块向量特征在每一个细胞系都...

问题 binGO富集分析

...文件，但是这个软件好像不能识别。想问一下这种情况该怎么做。 希望您能提供一些帮助，谢谢！

文章 immune_compare_stat.r 免疫细胞表达差异比较

使用说明： $ Rscript $scriptdir/immune_compare_stat.r  -husage: /work/STAD_immu_demo1/scripts/immune_compare_stat.r [-h] -i filepath -v                                                           celltype                                        ...

文章 IF=8.86|肝癌免疫相关lncRNA预后标志物文献解读

...mune Landscape of Human Hepatocellular Carcinoma 背景介绍 1.尽管肝细胞癌 (HCC) 发生率与死亡率很高，其致病因素繁多，但HCC 的药物治疗也取得了相当大的进展，尤其是免疫检查点抑制剂 (ICI) 2.lncRNA 与 DNA、RNA 和蛋白质相互作用并表现出...

问题 宏基因组分析，用来分组的metadata格式具体是什么？

问题 由于gff3文件第九列的格式问题，无法运行课程的脚本

图1为我研究对象基因组GFF3文件，图2为demo里拟南芥GFF3文件，由于我研究对象的基因组数据只能从NCBI下载，格式问题导致无法运行部分课程脚本，请问老师应该如何解决。

问题 用figtree编辑进化树是出现问题

老师好，我在使用figtree编辑进化树时，在编辑branch lables，也就是设置bootstrap值时，我选择了Roman格式，结果进化树上就没有显示bootstrap值，如下图这个怎么解决呀，望老师赐教