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文章 施一公:如何提高英文的科研写作能力

...文,最重要的是逻辑。逻辑的形成来自对实验数据的总体分析。必须先讨论出一套清晰的思路,然后按照思路来做图(Figures),最后才能执笔。 3.具体写作时,先按照思路(即Figures)写一个以subheading为主的框架,然后开始具...

文章 RNA-seq发文必备技能——GEO数据库上传

...程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学...

文章 计算肿瘤纯度和免疫评分 R包总结

...方法为CIBERSORT与ssGSEA CIBERSORT:优势:R包简便,也有网页在线操作优势显而易见。“LM22”文件中只有22种免疫细胞。  ssGSEA :根据输入的gmt文件即可指定免疫细胞,之后对每个样本计算出其免疫细胞的富集得分。其中最明显的...

问题 GWAS分析的表型数据符合正态分布,但是极值材料表型是真实存在的,所以是保留原始数据还是用IRNT转换表型值或者剔除符合正态分布的值呢

问题 win10企业版本,专业版本安装docker失败 WSL 2 installation is incomplete.

问题 请问如果系统是windows server 2016版的话安装docker的话应该选择哪个版本

文章 Root microbiota assembly and adaptive differentiation among European Arabidopsis populations

...择细菌的V5-V7区和真菌(包括卵菌)的ITS1区序列经行后续分析。序列被聚类成OUTs,在扩增子序列变异体(ASV)分辨率上验证了结论的可靠性。2. Convergence in root microbiota composition across A. thaliana populations. (拟南芥物种根微生物组...

文章 运行Linux版本ProteoWizard中的chainsaw工具时报错

chainsaw工具,用于预测蛋白序列的酶切结果 运行命令: chainsaw test.fasta 报错: locale::facet::_S_create_c_locale name not valid 解决: 在当前环境中运行命令 export LC_ALL=C; unset LANGUAGE 之后再操作chainsaw工具,屏幕输出: Reading database: ...

问题 TBtools 的others界面下没有BioSequence Structure Drawers——Amazing Optional Gene Viewer

...图: 请问这是什么原因呢?我的TBtools软件是在基因家族分析课程里下的。

文章 16S多样性分析docker镜像发布及使用

...micsclass/ampliseq-q1:latest    #启动并进入镜像 安装软件及版本介绍 OTU分析相关软件 qiime1 v1.9.1mothur  v.1.25.0usearch   10.0.240usearch61 6.1.544vsearch v2.15.0 序列处理相关分析包 flash v2.15.0 序列合并bioperl biopythonfastqcmultiqcfastp  qi...

文章 说好了哭 | 周杰伦是最懂青春的人,CORNERSTONE只想成为最懂你的人

...慢1秒,可能导致总共损失25万元的销售额。 Compuware公司分析了超过150个网站和150万个浏览页面,发现页面响应时间从2秒增长到10秒,会导致38%的页面浏览放弃率。   如何评估软件的性能? 性能测试有两个重要的指标:TPS和...

文章 两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图!

...形式的系统进化树 树形可供选择。大家可以根据自己的分析目的来选择合适的树形。矩形进化树: 辐射状进化树: 环状进化树: 选择好树形后,如果觉得还够美观,我们可以对树枝进行调整(我们拿环状进化树进行...

问题 那现在这个挂成功的问题能解决吗,目前着急使用,之后再学习docker进行其他分析

文章 网络概念以及Cytoscape导入数据格式理解(ceRNA等多元关系网络数据)

...多元关系网络:lncRNA——miRNA——mRNA ,或者其他的一些分析数据显示出来的多元关系。 直接看Cytoscape数据文件格式,很多人会想:难道数据要整理成下面这样? Node1 Node2 Node3 lncRNA miRNA mRNA ...

文章 python 版本的mcscan 绘图输出报错, need more than 3 values to unpack

多余的空行删除一下,解决问题 edge文件输入错误导致