五个样本,二三代各有数据,数据大小15g左右 目标是完成二三代联合组装,分箱MAGs,基于组装草图 ,MAGs 的双维度物种注释,微生物丰度量化,功能注释,最终输出标准化结果,交付内容基于分箱和组装的物种注释,丰度表...
复盘RNAseq自主分析课程内容,在生成gene length文件时,产生上述报错。 代码:RUN CMD: python /work/rnaseq_demo/my_rnaseq/scripts/get_gene_length_from_gtf.py -g Homo_sapiens.GRCh38.101.chromosome.22.gtf -p gene_length 报错:bash: RUN: command not found
...el中完成修改,结果如下:之后,#建立注释库 retrieve_seq_from_fasta.pl --format refGene --seqfile ${ref}.fa ${ref}_refGene.txt --out ${ref}_refGene.fa ,在此过程中出现许多错误并得到最终的${ref}_refGene.fa,请老师帮忙看看是否正常
下载omicsclass/reseq的时候出现这个问题Error: writing blob: storing blob to file "/var/tmp/storage2970342573/11": happened during read: unexpected EOF,请教各位老师如何解决
总是下载一半提示‘ writing blob: storing blob to file "/var/tmp/storage4013771095/38": happened during read: unexpected EOF’ 有时候还会报‘client_loop: send disconnect: Broken pipe’ 该如何解决?(服务器为贵司的共享服务器)
...下载 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/archive/refs/tags/4.6.2.0.tar.gztar zxvf gatk-4.6.2.0.tar.gzcd gatk-4.6.2.0 配置 ./gradlew bundle 问题 解决 对gatk-4.6.2.0/gradle/wrapper下面的gradle-wrapper.properties这个文件进行更改,主要是更改这个文件的dis...
老师,你好! 在本地使用shell 使用conda activate picrust2运行picrust2_pipeline.py命令后出现以下界面,请问这个问题应该怎么解决?
...ant_function file (exonic format error): <line79synonymous SNVLOC119691921:XM_048633226.1#NC_063982.1#16995:exon3:c.C99T:p.L33L,LOC119691921:XM_048633233.1#NC_063982.1#16995:exon3:c.C99T:p.L33LNC_063982.11813318133CT0.43752219.779NC_063982.118133.CT2219.77PASSAC=7;AF=0.438;AN=16;BaseQRankSum=-2.6...