找到约 15 条结果

问题 单细胞测序数据进行细胞通讯分析

进行猪样本的单细胞测序数据进行细胞通讯分析时,cellphonedb method statistical_analysis meta.tsv normalize.data.tsv \   --counts-data hgnc_symbol   --iterations=100 --threads=1,这个代码里面 --counts-data hgnc_symbol 中的"hgnc_symbol"需要修改吗?改为什么...

问题 pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

您好,看了您发的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》的帖子,受益很多。我自己也刚接触三代测序的数据,现在是拿到原始数据了,做得是无参物种,做到“lima ccs.bam barcoded_primers.fasta  demux.ccs.bam --isoseq --no-pbi...

话题 pacbio 三代全长转录组数据分析流程

文章 IF=8.78|非肿瘤数据挖掘思路(GWAS Catalog)

...用到两个表型的情况。cFDR通过整合两个GWAS Meta汇总统计数据,以与第二个表型的关联程度为条件确定SNPs变异位点数据集,鉴定与第一个表型关联的位点。待检测的关联表型称为“主要表型”,第二个表型作为“条件表型”。Andr...

文章 了解我们!

...生命科学研究之中。 但高通量测序有其自身特点,尤其数据量巨大,这就造成了它即使像PCR一样普遍也不可能像PCR一样普通,因为大部分人难以逾越数据分析这条鸿沟! 在可预见的未来,测序会越来越便宜,甚至会出现免费...

文章 ggplot2图例位置legend.position调整

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 CGVIEW:微生物基因组和质粒圈图绘制分析软件

...trand' 正负连 3)  blast结果文件(demo) 这些列必须得有数据:query_id, %_identity, q_start, q_end,alignment_length, evalue,其他可空。 2.       生成XML文件:perl /share/work/biosoft/CGView/cgview/cgview_xml_builder/cgview_xml_builder.pl -sequence demo.fa -o...

问题 老师,构建泛基因列表使用的vcf文件,是下面图中的sv数据吗,下面表格包括了CHROM,POS,REF,ALT,TYPE,MAF,MIS,ANN,将这些数据整理成vcf吗?

网站为http://111.203.21.71:8000/multi-omics/variation.html    ,老师您可以帮忙看一下吗?另外,这个表格是不可以下载的,需要手动复制,麻烦您

问题 R语言农艺性状表型数据与环境关联互作代码分析

您好,我想申请一下这里的涉及的表型示例数据? 请问方便分享吗? 我的邮箱:276398980@qq.com 感谢

问题 重测序数据可以用来做基因家族的共线性分析

我看在比较基因组或者基因家族鉴定中有这一部分的分析,请问老师,手头上只有重测序的数据,又想看看某个基因家族是否扩张和加倍的话,可以怎么入手呢? ?

文章 饼图pie-ggplot2

...点是饼图的排布是按照aes(fill)的因子顺序确定的。譬如数据如下 > dat  type Num1    A  902    B  343    C  564    D  995    E  15 必须根据数据先确定mapping 中aes(fill)的因子顺序,譬如这里会按照dat$type 填充,...

问题 请问有没有二穗短柄草的表达量数据库?

请问有没有二穗短柄草的表达量数据库?

文章 如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)或者Symbol

...77201 127064 OR2T12 相关课程:TCGA-差异基因分析、GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化、TCGA临床数据生存分析、TCGA-转录因子分析、TCGA-ceRNA调控网络分析 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家...

问题 无法下载TCGA数据,怎么弄

我实在是无法解决这个报错 老师能远程帮我下载一下吗,我就是根据课程的代码弄得,

问题 对基因家族比对结果验证,不同数据库的反馈差异很多,求解惑

...到的所有序列都未得到有效验证,如下图: 但CDD和pfam数据库的验证显示,分析得到的序列结果基本都通过了验证 请问这样大的差异,结果是否还可用?为什么差别这么大呢?smart也用的是最新版数据库。