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问题 转录组数据怎么看测序深度?

我做的物种基因有1G,测了6G的转录组,测序深度是不是就是6乘呢?

问题 Nr数据库注释结果可靠吗?

问题 R语言处理GEO数据的问题

问题 您好,请问怎样做转录组数据分析?

问题 转录组数据怎么样用来写文章

问题 putty下载基因组数据太慢

问题 老师你好,我看了你多芯片illmina 标准化的视频,用你的代码发现处理不了GSE29248的数据,我发现这个矩阵的列和你视频教的不一样,不知道这种数据如何处理???

输入lumiR.batch后,提示错误?

文章 qRT-PCR相对定量计算详解 qPCR

...表达定量的方法,他的计算方法有很多,常用的相对定量数据分析方法有双标曲线法,ΔCt法,2^-ΔΔCt法(Livak法),用参照基因的ΔCt法和Pfaffl法。这里主要讲解常用的2^-ΔΔCt法(Livak法)如何计算; qRT-PCR原理: 以基因的cDNA为模板...

文章 了解我们!

...生命科学研究之中。 但高通量测序有其自身特点,尤其数据量巨大,这就造成了它即使像PCR一样普遍也不可能像PCR一样普通,因为大部分人难以逾越数据分析这条鸿沟! 在可预见的未来,测序会越来越便宜,甚至会出现免费...

问题 GWAS计算表型数据blup时一直出错

老师,请问下我的这个为什么一直报错,我只有一年的数据,即使我加了Header那一行也会报错,我的性状是性别,二分类性状,不知道能不能用这个代码计算,以下是我的表型信息以及报错信息,望解答,谢谢!Group.rm_outers.txt

文章 CGVIEW:微生物基因组和质粒圈图绘制分析软件

...trand' 正负连 3)  blast结果文件(demo) 这些列必须得有数据:query_id, %_identity, q_start, q_end,alignment_length, evalue,其他可空。 2.       生成XML文件:perl /share/work/biosoft/CGView/cgview/cgview_xml_builder/cgview_xml_builder.pl -sequence demo.fa -o...

文章 ggplot2图例位置legend.position调整

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 有参转录组数据分析镜像升级v2.0

...seq:/work omicsclass/rnaseq:v2.0 如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像,老用户重新下载示例数据压缩包   课程链接:https://bdtcd.xet.tech/s/29EigM

问题 pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

您好,看了您发的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》的帖子,受益很多。我自己也刚接触三代测序的数据,现在是拿到原始数据了,做得是无参物种,做到“lima ccs.bam barcoded_primers.fasta  demux.ccs.bam --isoseq --no-pbi...

问题 老师,构建泛基因列表使用的vcf文件,是下面图中的sv数据吗,下面表格包括了CHROM,POS,REF,ALT,TYPE,MAF,MIS,ANN,将这些数据整理成vcf吗?

网站为http://111.203.21.71:8000/multi-omics/variation.html    ,老师您可以帮忙看一下吗?另外,这个表格是不可以下载的,需要手动复制,麻烦您