...功能是保持体内平衡,包括酸碱平衡,水平衡,血压调节和葡萄糖稳态在内的功能需要肾脏进行精确的协调和调节。全球大约9%的人口正在遭受慢性肾脏疾病。近年来,研究表明肠道菌群和慢性肾病(CKD)相关,已有研究表明...
在带有GROUP信息的structure图当中,每一个K值柱状图下面的样品顺序都是相同的,能不能直接在最下面或者最上面显示样品名而不是在每个图下面显示,代码因该如何修改 这个是绘图的代码 p<-plotQ(qlist,imgoutput="join",#showlegend=T,r...
... 相同类型细胞合并聚类。根据一种细胞类型的受体表达和另一种细胞类型的配体表达得到这两种细胞类型之间的受体-配体相互作用关系。对于同种类型细胞内的每个基因,计算表达该基因的细胞百分比和表达均值。在统计分...
... HNSCC 进展过程中的相互作用,我们对正常、白斑、HNSCC 和转移性 HNSCC 组织进行了单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 分析。我们鉴定了表达 LGALS7B 的恶性细胞和表达 CXCL8 的成纤维细胞的新克隆,肿瘤组织中这些细胞的丰度与较差的预后结...
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在MEGA中生成的进化树没有问题,但是用figtree打开nwk文件后两条序列并在了一起?请问怎么解决? 作基因结构+进化树的图也是会合并在一起。
...法潜在机制方面的应用很少。我们对结直肠癌患者的免疫和基质群体进行了 scRNA-seq 分析,确定了特定的巨噬细胞和传统树突状细胞 (cDC) 亚群作为肿瘤微环境中细胞串扰的关键介质。定义小鼠肿瘤中可比较的骨髓细胞群,能够表...
细胞死亡的方式主要有两种,包括细胞坏死(necrosis)和细胞凋亡(apoptosis)。细胞坏死是早已被认识到的细胞死亡方式,而细胞凋亡是近年来逐渐被认识且越来越受到重视的细胞死亡方式。两种死亡方式最重要的区别是细胞坏死...
...获得差异表达的基因之后,可以将差异表达的基因在癌症和癌旁中的数据拿出来进行比较一下,看看两者差别是否显著。 # 绘制差异表达基因在比对样本中的表达情况 # 将表达量进行log2 转换 normData1 <- log2(normData) # 对表达数...
...o运行一下,结果如下: 可以看到它把蛋白与微生物合并一起计算相关性了,我们让他修改一下不合并。 让AI帮助我修改可视化效果 修改后的绘图结果如下所示: 这里使用颜色表示相关性的强度,我们可以让他改成使用圆圈...
...一些基本的免疫细胞类型,而不是详尽的分类。细胞类型和Marker Gene 可能会因研究背景和分析流程而有所不同。 免疫细胞亚型Marker Gene 示例CD4+ T Helper 细胞CD4、IL2RA、FOXP3(调节性T细胞,Treg)CD8+ 细胞毒性 T细胞CD8A、CD8B、GZMB(G...
...义上的差异,这时候面对那么多统计学检验方法,我们该怎么选择最适合我们数据的检验方法至关重要了,因为选错了检验方法很可能导致错误的结论!这里我以微生物多样性研究中所涉及到的统计学检验方法给大家总结一下;...