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文章 ggplot从数据图形绘制逻辑

...的统计变换,最后绘制在某个特定的坐标系中,而分面则可以用来生成数据不同子集的图形。 一张统计图形就是由上述这些独立的图形部件所组成的。 最基础的部分是你想要可视化的数据(data)以及一系列将数据中的变量对应...

问题 求教:我用conda 安装qtlseq后,里面安装了trimmomatic,可以,但是在运行qtlseq的命令的时候,却出现错误/bin/sh: trimmomatic: command not found

我用conda create -n qtlseq python=3 qtlseq安装qtlseq后,运行这个程序,但是出现/bin/sh: trimmomatic: command not found这个错误,查看是不是安装了这个软件 如第二张截图,这个软件已经安装了,并用conda list 检查了一下,发现在qtlseq环境下...

文章 为什么大公司一定要使用 DevOps?

究竟什么是DevOps? 要想回答这个问题,首先要明确DevOps这个过程参与的人员是谁,即开发团队和IT运维团队。那么,DevOps的意图是什么呢?即在两个团队之间,建立良好的沟通和协作,更快更可靠的创建高质量软件。   事实上...

文章 SCI期刊版面费一般是多少?为什么这么贵?要自己出钱吗?

谈钱就伤感情了,但是版面费这个钱不得不谈! 一篇论文反反复复打磨,好不容易投稿了!——回复了!——录用了! 还有比这个更兴奋的事情么?当然有! 版面费! 能让人吐血的版面费! 而且据说有些导师会让学生自掏腰包支...

文章 你了解SAM和BAM文件吗

...数值含义不同,其列表如下: 中文解释: 1 : 代表这个序列采用的是PE双端测序2: 代表这个序列和参考序列完全匹配,没有错配和插入缺失4: 代表这个序列没有mapping参考序列上8: 代表这个序列的另一端序列没有比...

文章 生物专业由冷转热?你还敢选生物专业吗?

...流传着这样的“预言”:“21世纪是生物的世纪”。 在这个“预言”的感召下,很多人毫不犹豫地选择了各大高校的生物专业, 当年大学的生物专业分数线硬是“高人一等”哦~ 而在以后的十几年里,生物专业招生由最开始...

文章 清华学生是如何度过大学4年的

...这条路是我们通向成功的捷径” 这里我举几个例子证明这个观点: 我在清华电子系的一个师兄,刘自鸿,他通过自己一年的钻研在去年全国大学生挑战杯科技竞赛上获得特等奖第一名,他的专利“人体生物传感芯片”被一家...

文章 Linux重定向以及nohup不输出的方法

...一个特殊的文件,被称为“空设备”或“空设备文件”。这个文件会丢弃所有写入它的数据,就好像一个黑洞一样。当你读取/dev/null时,它立即返回一个文件结束(EOF)标记。 当我们不想要任何输出信息的时候,我们可以把...

文章 pyvcf的安装

...然还在使用python2编写,因此为了使用它,需要用use_2to3这个小模块,毫无疑问,这是一个相当老的模块,因此无法在最新版的setuptools上使用,因此我们可以先将setuptoos降级58.0以下,比如 pip3 install setuptools==57.5.0 然后再...

文章 kaks和dnds是什么?

...的非同义替换率(Ka)和同义替换率(Ks)之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 让我们从最基本的道理开始讲起。如果你手头有两个不同物种的同一个基因的序列,比如人和小鼠的p53基...

文章 iTOL绘制好看的系统发育树

...、基因家族和物种进化分析中经常会看此类图片。 像这个 还有这个 是不是很漂亮?你的呢?还是像这个吗? 想要让你的图像别人的那样漂亮吗? 来,我给你推荐一款强大好用的在线软件绘图工具—iTOL,让你的论...

问题 老师您好,我想问一下在GEO中的双通道芯片里面可以下载的series_matrix.txt文件中的数值是有正负求的,并且数值基本没有超过10的,是不是说明这些值已经是处理和对照的比值然后取了log2所得的呢,如果是的话我是不是可以直接通过观察这个文件里面的值就可以我所研究的基因有没有发生上调和下调,然后可以直接用这个值来做我的基因家族成员表达的热图吗

文章 最好用的测试管理工具是什么?

...用习惯。 二、测试用例模板设置 作为一名测试人员,这个功能我要疯狂打call!!你们知道的,测试员写用例是必不可少的工作,有时写用例,模板内容需要重复输入,特别烦,但CORNERSTONE解决了我这个烦恼!它可以自定义用例...

文章 敏捷实践经验分享,企业如何在敏捷开发中实施DoD

...要把自动化用例写完并测试通过才算完成。   为了避免这个问题,在敏捷软件开发中,常用Definition of Done“完成的定义”来表示工作是否已完成,不同的活动有不同的完成定义。首先要知道,所有的DoD都不是一成不变的,在随...

文章 如何处理矫正GEO数据批次效应(batch effect)

...些数据直接混合分析吗?如果贸然混合,会有什么问题?这个问题就是batch effect。 什么是batch effect? 不同平台的数据,同一平台的不同时期的数据,同一个样品不同试剂的数据,以及同一个样品不同时间的数据等等都会产生...