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问题 您好,用tassel做gwas的时候质量性状的输入格式和质量形状的输入格式是否一样呢?

问题 细胞测序得出蛋白表达如何与GEO data已发表的数据进行比对以验证数据的有效性

问题 蛋白三维结构预测遇到问题:当在swiss-model中选择使用模板的方法时,在上传模板的时候发现因为以下问题没法上传

...方法,从PDB数据库中下载经过PSI-BLAST比对获得的模板的PDB格式文件,在swiss-model中,使用自己模板的方法进行三维结构预测,结果在上传文件的时候遇到以上的问题,请问怎么解决。 Chains A, B of the uploaded template do not start with resi...

问题 想请教一下,conet网络构建的课程,用提供的数据文件分析完全可以,但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式,并把数据形式改成和课程提供数据完全一样,再转化成txt制表符文件格式后输入,选择第二个选项(由biom格式转化来的文件),结果报错。把测序公司提供的biom格式文件输入,选择第三个选项(biom HDF5格式,还是报错)。这是什么问题呢?

文章 组装"预实验" | 物种倍性分析

...性分析有哪些方法? 1.实验方法 压片法: 通过促进细胞有丝分裂,使用秋水仙素使细胞分裂停止在有丝分裂中期,然后固定、酶解、染色、烘烤等方法将细胞染色体固定在载玻片上,使用核型分析显微镜观察分析染色体的...

问题 高通量下载数据格式

...的下载。我想问一下,直接按照runinfo 信息下载的数据的格式是什么格式?如何转化为fastq格式? 如下面的下载地址:https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos2/sra-pub-run-11/SRR1218151/SRR1218151.1

文章 非小细胞肺癌(GSE123904)

..._seurat_obj.r -i `ls *.afterQC.rds` \    -o $project/01.qc -p lung 单细胞转录组分析课程推荐:https://bdtcd.xetslk.com/s/4i88K6

问题 请问如何将otu_table. biom格式的文件转换成txt格式文件

我搜索到的关于biom文件转换txt文件是在Python上运行一组代码,但是我没有用过Python,试着输代码后总是报错。希望有知道的老师告诉我一下biom转txt的具体流程,谢谢!

文章 小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

...达数据,设置了八个样本(如下图),大家可以按照文件格式准备数据,注意:数据另存成Tab键分隔的文本格式进行使用哦! 数据载入通过File,点击Load Data开始(如下图A),跳转到数据导入窗口,选择准备的txt文件,进行...

话题 APE软件 序列比对分析软件

文章 蛋白质组分析软件MaxQuant

...白质组学也慢慢火起来了。 那么分析蛋白质组的数据的软件,那个值得推荐呢? 我查询了不少资料,发现不少蛋白质组分析软件都偏向于收费,而且很多都是windows上运行。在众多软件中,我比较推荐MaxQuant 。 主要有如下理由...

问题 使用图中这条命令时参考序列格式是fasta.gz格式有影响吗,需要转化为fasta格式吗;此外我这个第一条命令jobs显示正在跑,后面的为什么不显示正在运行了啊,是有哪里错了吗?

文章 如何制定OKR,打造高绩效团队?

...所以,目标的设置容易缺乏野心。另一方面,OKR被视作是管理的【变革】,那自然是不破不立,想让员工否认自己正在做的工作,恐怕比“为了失败而工作”更难接受。OKR的原则和实施过程并不复杂,但其中蕴含的管理思想一点...

文章 linux下查看磁盘及文件大小命令du,df

...ble」的输出,也就是在档案系统大小使用 GB、MB 等易读的格式。     上面的命令输出的第一个字段(Filesystem)及最后一个字段(Mounted on)分别是档案系统及其挂入点。我们可以看到 /dev/sda1 这个分割区被挂在根目录下。    ...

问题 我有一组数据想做个heapmapper热力图,您能帮我处理一下吗,我打开网址不会用,1为想关性,2为显著性

                   Mn Zn Cu Pb Cd As Hg 1 -0.661 -0.675 -0.227 -0.67 -0.623 0.072 0.027 2 0.004 0.003 0.381 0.003 0.008 0.784 0.919 3 -0.662 -0.685 -0.327 -0.721 -0.612 0.286 -0.081 4 0.004 0.002 0.2 0.001 0.009 0.265 ...