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问题 我的Conda 根本安装不成功软件，比如UMI tools ，怎么办

... DistributionNotFound(req, requirers) pkg_resources.DistributionNotFound: The 'umi-tools==0.2.3' distribution was not found and is required by the application

文章 EggNOG基因序列批量注释

EggNOG (Evolutionary Genealogy of Genes: Non-supervised Orthologous Groups)是基于直系同源蛋白进行分组比对的一个公共资源数据库，由EMBL维护，提供了不同分类水平蛋白的直系同源分组（Orthologous Groups ，OG），包括真核物种、原核物种及病毒...

文章 Python学习-利用Python对植物基因组注释文件（gff3格式）进行处理

...])+'\n') input_file.close() # make by ligaojie from North China University of Technology（华北理工大学生命科学学院生物信息学）

文章 UpSetR包绘制多维的venn图

...ist('A','B','C'), color = "orange", active = T))) ### sort by frequency of intersection upset(fromList(dataForUpSetPlot), nsets=length(dataForUpSetPlot), nintersects = 1000, sets = c("A", "B", "C", 'D'), #keep.order = TRUE, point.size = 3, line.size = 1, ...

文章 GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据

...上图内容。 差异分析 点击分析页面左下角Compare 2 sets of samples，第一步，选择检验方法和阈值（见下图A）；第二步，选择差异对比组，点击Select which Samples to put in Group A and Group B，出现样品处理信息，据此设定A组样品和B组样...

问题 使用悟空云平台进行代谢组数据矫正时报错

其余五种归一化方式均正常，只有QC-RLSC报错显示error in evaluating the argument X in selecting a method for function "t: NA NaNI nf in foreign function call (arg 5)

问题 成功安装WGCNA包后，调用时报错

....30.4), R 3.5.2 (2018-12-20) Installing package(s) 'WGCNA' also installing the dependency ‘GO.db’trying URL 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/contrib/3.5/WGCNA_1.66.zip' Content type 'application/zip' length 3436551 bytes (3.3 MB) downloaded 3.3 MBpackage ‘WGCNA’ success...

问题 gatk4 HaplotypeCaller报错

...R has occurred: Bad input: We encountered a non-standard non-IUPAC base in the provided input sequence: '13' 请问这个怎么解决呢？

问题 基因家族数据准备运行错误

...1: No ID attribute found  ************** Too much WARNING message we skip the next **************

问题 16S FastMap文件如何填写能否像详细讲解一下，视频中说tap1文件就是ckd就是肾病患者的简称填写吗，我搜到的是tap列通常用于记录与每个样品关联的分类工具或方法的信息。像这样，能否详细说明一下

...r sample from river S3 BC3 F341 Control MOTHUR v.1.45.1 with SILVA SSU Ref NR99 Sediment sample from lake

问题 perl双层哈希赋值

...d11723.40' => 1                  },          '45' => {                    'Gbscaffold1258.3_scaffold1258.4' => 1,                    'Gbscaffold1258.2' => 1                  }, ————以下省略—...

问题 你好老师有关网络图绘制的问题

...制OTU与环境因子网络图时，1是用MENA平台分析时在Construct the network模块分析时导入环境因子按照顺序一步步操作会出现一个窗口please upload your file with node annotation here.请问这是上传哪个文档啊，后面怎么操作呢(因为网上看到的博...

文章 GEO数据库挖掘—WGCNA鉴定骨肉瘤转移相关基因

...12个基因，对该17个样本可以进行准确的分类（accuracy rate of 94.4%，见下图），GSE21257、 GSE32981、GSE14827数据进行验证，GSE14827准确率96.3%，GSE32981准确率95.7%，GSE21257准确率92.3%。 结论 基于筛选分析以及对筛选基因的功能注释结果...

问题 基因家族分析 kaks分析

...nal.pl: [NA] Please make sure Epal2nal.pl is executable (+X) and put into the global directoryy. l total 118M 运行ParaAT批量比对脚本后，显示以上内容。

问题 我用conda 根本安装不了软件，非常慢，比如UMI-tools

... DistributionNotFound(req, requirers) pkg_resources.DistributionNotFound: The 'umi-tools==0.2.3' distribution was not found and is required by the application