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文章 ggplot2分面facet_grid调整坐标

...不一致,坐标固定后,x轴出现的空白的刻度,没有对应数据,设置之后scales=“free"之后,数据分布更合理。 p_box=p_box+facet_grid(.~Type,scales="free")p_box 如果想提升自己的绘图技能,我们推荐:R语言绘图基础(ggplot2) 更...

文章 Vennerable包的安装

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

话题 植物基因组数据处理

文章 使用hisat2软件将测序数据比对到基因组

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 关于mirna预测靶基因数据库的下载

各位老师好,我现在准备下载mirna预测靶基因的数据库targetscan,但是不知道该下载哪个文件,请老师解答一下。

文章 远程服务器登录putty(云服务器,实验室服务器等)

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 ggplot2控制坐标轴截距交点位置(原点)

...或者scale_x_discrete,这里针对连续性进行介绍: 参考画图数据和代码   https://www.omicsclass.com/article/92 修改y轴连续性坐标起点: Y=p+  scale_y_continuous(expand=c(0,0))Y 如果针对x离散型的调整呢?尝试调整数,使柱子紧贴Y轴 X=p+ ...

问题 SRA数据下载

...-host fasp.sra.ebi.ac.uk --user era-fasp --file-list fastq.txt ./ 下载SRA数据时总是断开,有什么办法可以让这个命令重复运行,能不能帮我写个shell 脚本 让这个命令一直运行。谢谢。

文章 RGB、Lab色彩模型

...时可以借助rgb2hsv()将rgb转化成hsv。 相关参考:GEO芯片数据挖掘                     R语言画图 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分...

问题 请问老师们,prism两组差异数值很小的数据怎么做折线图

不知道我能否描述明白求助的问题,如下图所示,想要做的两组数据大概是0.0016和0.0012的区别,请问该怎样在prism的折线图上把两组数据分开呢

文章 R语言sort()与order()

...家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA...

问题 WGCNA分析,前期数据载入Rstudio中出现“error reading from connection”,这该怎么解决?我看到官方网站就是这样的代码。

在将表性数据与模块数据进行联合分析来识别高度关联的模块的过程中,界面不小心关掉了,我想将前期保存的数据进行调进来进行分析。但是在第二部建立模块的数据调入过程中,总出现“error reading from connection”,这需要怎...

文章 误差线该用标准差还是标准误?

...用特定的置信区间(譬如,95%的区间) 误差线 主要指示数据每一个数据点的误差(或不确定性)范围,显示潜在的误差或相对于系列中每一数据标志的不确定程度,以更准确的方式呈现数据【参考1】 Wikipedia 也对误差线(erro...

文章 混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值 计算育种值与GWAS表型性状数据整合

...值的方法要配套,最好的方法目前就是BLUP。 BLUP是一种数据分析方法,用的是线性模型方程组,采用的是最小二乘法,目标是离差平方和最小。 你有一些试验数据,很想对这个数据进行分析,找出里面的规律,对数据的分...

问题 关于DNase-seq数据分析的问题

老师,您好,请问一下DNase-seq在数据分析时候需要去除PCR克隆吗?谢谢您