文章 RGB、Lab色彩模型

...时可以借助rgb2hsv()将rgb转化成hsv。 相关参考：GEO芯片数据挖掘                     R语言画图 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分...

问题 WGCNA分析，前期数据载入Rstudio中出现“error reading from connection”，这该怎么解决？我看到官方网站就是这样的代码。

在将表性数据与模块数据进行联合分析来识别高度关联的模块的过程中，界面不小心关掉了，我想将前期保存的数据进行调进来进行分析。但是在第二部建立模块的数据调入过程中，总出现“error reading from connection”，这需要怎...

文章 R语言sort()与order()

...家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA...

问题 MENA网站上传数据提示错误

老师好，我在MENA网站上传数据时总出现如下提示 Software error: Couldn't open D:\wwwroot\MENA\ori_files\shy666..\MENAPH1.txt for writing: No such file or directory at D:\wwwroot\mena\upload_result.cgi line 95. For help, please send mail to this site's webmaster, giving this err...

文章 误差线该用标准差还是标准误？

...用特定的置信区间（譬如，95%的区间） 误差线 主要指示数据每一个数据点的误差（或不确定性）范围，显示潜在的误差或相对于系列中每一数据标志的不确定程度，以更准确的方式呈现数据【参考1】 Wikipedia 也对误差线（erro...

问题 您好，想问一下苹果电脑的powershell怎么导入数据？

您好，想问一下～苹果电脑的powershell怎么导入数据？因为苹果电脑就一个盘，不知道该怎么编辑代码～谢谢～

文章 KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载

我们下载KEGG数据库的目的是为了研究目标蛋白参与了那些pathway 。 前面我们介绍了KEGG 数据库中蛋白序列的下载方式，现在来介绍一下patyway 相关数据的下载方式。这个主要采用KEGG 的API 进行获取，思路如下： 1. KEGG 有那些pathwa...

文章 混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值 计算育种值与GWAS表型性状数据整合

...值的方法要配套，最好的方法目前就是BLUP。 BLUP是一种数据分析方法，用的是线性模型方程组，采用的是最小二乘法，目标是离差平方和最小。 你有一些试验数据，很想对这个数据进行分析，找出里面的规律，对数据的分...

文章 ImmuCellAI 免疫细胞估算，RNA-seq 和芯片数据

... 在该分析方法中，ImmuCellAI能够基于RNA-Seq或芯片的转录组数据，准确地估计18种T细胞和6种其他类型免疫细胞的比例，包括B细胞，NK细胞，单核细胞，巨噬细胞，中性粒细胞和树突状细胞；同时，该网站还能预测患者对免疫检查...

问题 对于标准化的数据应该如何绘制火山图呢？

因为数据有正负之分，此时直接求比值就不能够体现出二者的大小差异，可以作差比较吗？

问题 GEO网站提供数据标准化结果负值

这是其中一个单样本信息，打开之后是这样的 这是我R语言下载得到的基因表达矩阵的一部分 问题：GEO下载下来的表达矩阵数据为什么有负值，能用吗，需要经过转换吗？

问题 HGMD数据库

老师您好，我在一个帖子中看到您提供了一个HGMD数据库下载的百度网盘链接，可能是时间太久了链接已经失效。 我的需求是这样的，我正在进行一个单基因遗传病的突变位点和表型关系的研究，这个基因不是什么热点基因，遗...

问题 使用qiime2导入数据时，一直报错，不知怎么解决。万分感激！！

老师们你好，我在使用docker做qiime2分析自己的数据时，讲数据导入qiime2这一步时，报错了，manifest文件按照视频里做的，找了很多原因一直都是同样的报错代码，不知道怎么办。麻烦老师可以指教下吗？？

问题 二代和三代sv数据合并出现问题，若能回答，万分感谢

用三代数据sv结果对二代数据进行基因分型，合并两个结果时出现问题，bcftools merge合并的结果，缺失率太大，导致用plink进行pca分析时因缺失率太高无法进行，survivor merge 1000 1 1 0 0 50，合并后样本名减少，并且计算Fst为几个固定...

问题 如何做生存分析，需要什么数据？