在做转录组分析的时候，A和B基因相似性很高，外显子上面只相差几个碱基，差异很小，内含子差异大一些，在做转录组表达定量的时候发现，将A基因的count值全部归到B基因上。A和B是复制基因，序列同源性很高，在RNA-seq分析时...
...方案”了－－mac上开发，虚拟机上编译 :) 用virtualbox的mac版本装了个ubuntu， 安装go语言编译环境，一切顺利。 在把编译过的程序拷到共享文件夹时报permission denied错误。 ls -lah 发现host (我把共享目录mount到这个文件夹了) 的权...
老师您好，公司帮我整理的last.gene.pair文件中pangenID为啥用品系的缩写命名呢，没有规律性。这个不影响后续的分析吗？
做完转录组测序分析，从公司拿到的结果中一般都会有GO富集分析的结果文件。公司的分析都是标准化的，相应的GO富集分析图上展示的一般是前20位富集程度最高的GO条目，没有经过qvalue值的筛选。如果你想筛选一下qvalue值或者...
想问一下这个审稿意见是什么意思？是转录组分析过程哪一部分不完整吗？下图是意见和我的转录组分析步骤。
就是go的注释号不一样而注释功能是一样的，这是什么原因，GSEA分析不能有重复的注释功能，应该怎么办
...型验证。免疫侵润分析方法：ESTIMATE （R包）和 CIBERSORT （在线工具），ssGSEA（GSVA)。 预后signature查找： 免疫评分聚类区分免疫亚型 根据ssGSEA 评估的样本不同免疫细胞的得分利用层次聚类法进行聚类可以将样本分为免疫侵润高...
...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学...
FigTree可以基于系统进化树分析文件nwk进行进化树显示和美化，具体可以参考：https://www.omicsclass.com/article/62 但是如果想要批量将进化树种的ID批量修改掉，可以参考下面的操作： 1、参考前面的链接导入nwk文件 2、准备一个注...
...下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）...
...目录，可以观看我们网易云课堂免费视频课程：Linux生信分析环境搭建 详细解释共享文件夹设置： 挂载共享目录，关键的就是这个命令，理解了这条命令，才能融汇贯通，举一反三： sudo mount -t vboxsf linux-share share 具...
mcscanX可以分析基因组内的共线性，分析详情见：mcscanX安装与使用;会输出很多文件,这里给大家解释一下，方便从结果文件中找到想要的信息： 1.T.tandem 基因组内所有的串联重复基因对 2.T.collinearity 基因组内所有的共线性...
...，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，做更牛的个性化分析，绘更漂亮的图，点这...